A hajót 1937. január 16-án bocsátották vízre a brémaiDeSchiMAG hajógyárból. A hajót eredetileg a Norddeutscher Lloyd teherszállító cég számára építették szállítóhajónak, mely a Ems nevet viselte, de 1939-ben, a második világháború kitörésekor az Emset segédcirkálóvá alakították.
A kereskedelmi hajók elleni portyáin, hagyományos fegyverzete mellett egy kis méretű, LS2 osztályú hajót, valamint Arado Ar 196 A1 típusú hidroplánokat is szállított.
November elején a Kometet ezúttal a japán Manio Maru szállítóhajónak álcázták, majd egy japán kikötőben feltöltötték üzemanyaggal és más ellátmányokkal. A Csendes-óceánon a Komet két másik segédcirkálóval együtt portyázott. Ez a két hajó a Mayebashi Marunak álcázott Orion, és a Tokio Marunak álcázott Kulmerland volt. 1940 novemberében a Komet egy norvég és hat brit kereskedelmi hajót süllyesztett el, melyek együttes vízkiszorítása 41 000 tonna volt. Az elsüllyesztett hajók Nauru szigeténél várták hogy foszfát-rakományukat berakodják. 1940. december 27-én a Komet ágyúzni kezdte a Nauru szigetén található foszfátüzemet. 1941 augusztusában az Orionnal közösen további két brit hajót süllyesztettek el, valamint elfoglalták a Kota Nopan nevű, 7300 tonnás holland szállítóhajót, melyet később Bordeaux-ba küldtek hadizsákmányként.
Második portyájára a Komet1942 októberének elején indult, Ulrich Brocksienkapitány irányítása alatt. Egy héttel Hamburg elhagyása után, október 14-én a hajót brit motoros torpedónaszádok támadták meg, Cap de la Hague közelében. A MTB 236 nevű hajó torpedói eltalálták a német hajót, mely teljes legénységével együtt elsüllyedt.