A Halobacteria egy Euryarchaeota törzsbe tartozó archea osztály.[1] Sóval telített vagy majdnem telített vízben élnek.
Az osztály tagjai magas sókoncentráció mellett növekednek. A Halobacteria az archeák elkülönült evolúciós ágát alkotja, és általában extremofileknek tekintik a tagjait, bár nem minden tagját lehet annak tekinteni. Nőhetnek aerob és anaerob módon is. A membránjuk egyes részei lilás színűek. Rendelkeznek bakteriorodopszinnal, amit fény elnyelésére használnak, ez pedig energiát szolgáltat az ATP előállításához.
Törzsfejlődés
Az extrém halofil aerob archeákat a euryarchaeota törzsbe, azon belül a Halobacteria osztályba, azon belül a Halobacteriales rendbe, azon belül a Halobacteriaceae családba sorolják, aminek 2015 májusában 48 nemzetsége és 191 faja ismert.
Domén: Archaea
Törzs: Euryarchaeota
- Osztály: Halobacteria
- Rend: Halobacteriales
- Család: Halobacteriaceae
- Haladaptatus [Hap.]
- Haladaptatus cibarius
- Haladaptatus litoreus
- Haladaptatus pallidirubidus
- Haladaptatus paucihalophilus (típusfaj)
- Halalkalicoccus [Hac.]
- Halalkalicoccus jeotgali
- Halalkalicoccus tibetensis (típusfaj)
- Halalkalicoccus paucihalophilus
- Halapricum [Hpr.]
- Halapricum salinum (típusfaj)
- Halarchaeum [Hla.]
- Halarchaeum acidiphilum (típusfaj)
- Halarchaeum nitratireducens
- Halarchaeum rubridurum
- Halarchaeum salinam
- Halarchaeum solikamskense
- Haloarchaeobius [Hab.]
- Haloarchaeobius iranensis (típusfaj)
- "Haloarchaeobius litoreus" (Antonie Van Leeuwenhoek, 2014, 105(6):1085-1090)
- Haloarcula [Har.]
- Haloarcula amylolytica
- Haloarcula argentinensis
- Haloarcula hispanica
- Haloarcula japonica
- Haloarcula marismortui
- Haloarcula quadrata
- Haloarcula salaria
- Haloarcula tradensis
- Haloarcula vallismortis (típusfaj)
- Halobacterium [Hbt.] (típusnem)
- Halobacterium jilantaiense
- Halobacterium noricense
- "Halobacterium piscisalsi" (szubjektív szinonímája a Halobacterium salinarumnak)[2]
- "Halobacterium ruburm" (Arch Microbiol, 2014, in press)
- Halobacterium salinarum (típusfaj)
- Halobaculum [Hbl.]
- Halobaculum gomorrense (típusfaj)
- Halobaculum magnesiiphilum
- Halobellus [Hbs.]
- Halobellus clavatus (típusfaj)
- Halobellus inordinatus
- Halobellus limi
- Halobellus litoreus
- Halobellus salinus
- Halobellus rarus
- Halobellus rufus
- Halobiforma [Hbf.]
- Halobiforma haloterrestris (típusfaj)
- Halobiforma lacisalsi
- Halobiforma nitratireducens
- Halococcus [Hcc.]
- Halococcus dombrowskii
- Halococcus hamelinensis
- Halococcus morrhuae (típusfaj)
- Halococcus qingdaonensis
- Halococcus saccharolyticus
- Halococcus salifodinae
- Halococcus sediminicola
- Halococcus thailandensis
- Haloferax [Hfx.]
- Haloferax alexandrinus
- Haloferax chudinovii
- Haloferax denitrificans
- Haloferax elongans
- Haloferax gibbonsii
- Haloferax larsenii
- Haloferax lucentense
- Haloferax mediterranei
- Haloferax mucosum
- Haloferax prahovense
- Haloferax sulfurifontis
- Haloferax volcanii (típusfaj)
- Halogeometricum [Hgm.][3]
- Halogeometricum borinquense (típusfaj)
- Halogeometricum limi
- Halogeometricum pallidum
- Halogeometricum rufum
- Halogranum [Hgn.]
- Halogranum amylolyticum
- Halogranum gelatinilyticum
- Halogranum rubrum (típusfaj)
- Halogranum salarium
- Halohasta [Hht.]
- Halohasta litorea (típusfaj)
- Halohasta litchfieldiae
- Halolamina [Hlm.]
- Halolamina pelagica (típusfaj)
- Halolamina rubra
- Halolamina salifodinae
- Halolamina salina
- Halomarina [Hmr.]
- Halomarina oriensis (típusfaj)
- Halomicroarcula [Hma.]
- Halomicroarcula limicola
- Halomicroarcula pellucida (típusfaj)
- Halomicrobium [Hmc.]
- Halomicrobium katesii
- Halomicrobium mukohataei (típusfaj)
- Halomicrobium zhouii
- Halonotius [Hns.]
- Halonotius pteroides (típusfaj)
- Halopelagius [Hpl.]
- Halopelagius inordinatus (típusfaj)
- Halopelagius fulvigenes
- Halopelagius longus
- Halopenitus [Hpt.]
- "Halopenitus salinus"
- Halopenitus malekzadehii
- Halopenitus persicus (típusfaj)
- Halopiger [Hpg.]
- Halopiger aswanensis
- Halopiger salifodinae
- Halopiger xanaduensis (típusfaj)
- Haloplanus [Hpn.]
- Haloplanus aerogenes
- Haloplanus litoreus
- Haloplanus natans (típusfaj)
- Haloplanus ruber
- Haloplanus salinus
- Haloplanus vescus
- Haloquadratum [Hqr.]
- Haloquadratum walsbyi (típusfaj)
- Halorhabdus [Hrd.]
- Halorhabdus tiamatea
- Halorhabdus utahensis (típusfaj)
- Halorientalis [Hos.]
- Halorientalis persicus
- Halorientalis regularis (típusfaj)
- Halorubellus [Hrb.]
- Halorubellus litoreus
- Halorubellus salinus (típusfaj)
- Halorubrum [Hrr.]
- Halorubrum aquaticum
- Halorubrum aidingense
- Halorubrum alkaliphilum
- Halorubrum arcis
- Halorubrum californiense
- Halorubrum chaoviator
- Halorubrum cibi
- Halorubrum coriense
- Halorubrum distributum
- Halorubrum ejinorense
- Halorubrum ezzemoulense
- Halorubrum halophilum
- Halorubrum lacusprofundi
- Halorubrum lipolyticum
- Halorubrum litoreum
- Halorubrum luteum
- Halorubrum orientale
- Halorubrum rubrum
- Halorubrum saccharovorum (típusfaj)
- "Halorubrum salinum" (Arch Microbiol, 2014, 196(6):395-400.)
- Halorubrum sodomense
- Halorubrum tebenquichense
- Halorubrum terrestre
- Halorubrum tibetense
- Halorubrum trapanicum
- Halorubrum vacuolatum
- Halorubrum xinjiangense
- Halorussus [Hrs.]
- Halosimplex [Hsx.]
- Halosimplex carlsbadense (típusfaj)
- Halosimplex pelagicum
- Halosimplex rubrum
- Halostagnicola [Hst.]
- Halostagnicola alkaliphila
- Halostagnicola bangensis
- Halostagnicola kamekurae
- Halostagnicola larsenii (típusfaj)
- Haloterrigena [Htg.]
- Haloterrigena daqingensis
- Haloterrigena hispanica
- Haloterrigena jeotgali
- Haloterrigena limicola
- Haloterrigena longa
- Haloterrigena saccharevitans
- Haloterrigena salina
- Haloterrigena thermotolerans
- Haloterrigena turkmenica (típusfaj)
- Halovenus [Hvn.]
- Halovenus aranensis (típusfaj)
- Halovivax [Hvx.]
- Halovivax asiaticus (típusfaj)
- "Halovivax limisalsi"
- Halovivax ruber
- Natrialba [Nab.]
- Natrialba aegyptia
- Natrialba asiatica (típusfaj)
- Natrialba chahannaoensis
- Natrialba hulunbeirensis
- Natrialba magadii
- Natrialba taiwanensis
- Natrinema [Nnm.]
- Natrinema altunense
- Natrinema ejinorense
- Natrinema gari
- Natrinema pallidum
- Natrinema pellirubrum (típusfaj)
- Natrinema salaciae
- Natrinema versiforme
- Natronoarchaeum [Nac.]
- Natronoarchaeum mannanilyticum (típusfaj)
- Natronoarchaeum philippinense
- Natronoarchaeum rubrum
- Natronobacterium [Nbt.]
- Natronobacterium gregoryi (típusfaj)
- Natronobacterium texcoconense
- Natronococcus [Ncc.]
- Natronococcus amylolyticus
- Natronococcus jeotgali
- Natronococcus occultus (típusfaj)
- Natronococcus roseus
- Natronolimnobius [Nln.]
- Natronolimnobius baerhuensis (típusfaj)
- Natronolimnobius innermongolicus
- Natronomonas [Nmn.]
- Natronomonas gomsonensis
- Natronomonas moolapensis
- Natronomonas pharaonis (típusfaj)
- Natronorubrum [Nrr.]
- Natronorubrum aibiense
- Natronorubrum bangense (típusfaj)
- Natronorubrum sediminis
- Natronorubrum sulfidifaciens
- Natronorubrum texcoconense
- Natronorubrum tibetense
- Salarchaeum [Sar.]
- Salarchaeum japonicum (típusfaj)
- Salinarchaeum [Saa.]
- Salinarchaeum laminariae (típusfaj)
- Salinigranum [Sgn.]
- Salinigranum rubrum (típusfaj)
- "Salinirubrum" ["Srr".]
- "Salinirubrum litoreum" (típusfaj) (Antonie Van Leeuwenhoek, 105:135-141)
Leírásuk
A növekedésükhöz sót igényelnek 2M vagy körülbelül 10%-os koncentrációban, az optimális növekedés általában sokkal magasabb koncentrációnál (tipikusan 20-25%) következik be. Azonban képesek nőni magasabb telítettségnél is, körülbelül 37%-os koncentrációnál.
Főleg hipersós tavakban élnek. A nagy sűrűségük gyakran vezet a víz rózsaszín vagy piros elszíneződéséhez (a sejtek magas szintű karotinoid pigmentekkel rendelkeznek, feltehetően az UV-sugárzás elleni védelem miatt).[4]
Rendelkeznek bakteriorodopszinnal, amit fény elnyelésére használnak, így energiához jutva az ATP előállításához. Másik pigmentje a halorodopszin, ami kloridionokat pumpál, előállítva egy feszültséggradienst, és ezzel elősegítve a fényből való energiatermelést. A folyamat nem áll kapcsolatban az elektrontranszportot magába foglaló fotoszintézis más formáival, és a halobacteria képtelen szenet megkötni szén-dioxidból.[5]
Gyakran tekintik pleomorfnak a tagjait, mert többféle alakot is felvehetnek, még egyetlen fajon belül is. Emiatt a mikroszkopikus eszközökkel való azonosításuk nehéz, és jelenleg helyette sokkal gyakrabban génszekvenálással azonosítják őket.
Egy rendkívül szokatlan alakú Halobacteria a Haloquadratum walsbyi. Négyzet alakú és extrém vékony, mint egy postabélyeg. Ez az alakja valószínűleg csak a víz magas ozmotikus koncentrációja mellett létezik.
A marsi légkör nyomása a víz hármaspontja alatt van, ezért édesvízi fajoknak nem lenne élőhelye a Mars felszínén, azonban felvetették, hogy a halobaktériumok talán kivételt képeznek, és még így is megélnének a bolygón.[6]
Jegyzetek
- ↑ See the NCBI webpage on Halobacteria. Data extracted from the NCBI taxonomy resources. National Center for Biotechnology Information. (Hozzáférés: 2007. március 19.)
- ↑ Minegishi, H., Echigo, A., Shimane, Y., Kamekura, M., Tanasupawat, S., Visessanguan, W., Usami, R. (2012) "Halobacterium piscisalsi Yachai et al. 2008 is later heterotypic synonym of Halobacterium salinarum Elazari-Volcani 1957." Int J Syst Evol Microbiol. 62: 2160-2162
- ↑ Qiu, X.X., Zhao, M.L., Han, D., Zhang, W.J., Dyall-Smith, M.L., Cui, H.L. (2013) "Taxonomic study of the genera Halogeometricum and Halosarcina: transfer of Halosarcina limi and Halosarcina pallida to the genus Halogeometricum as Halogeometricum limi comb. nov. and Halogeometricum pallidum comb. nov., respectively." Int J Syst Evol Microbiol. 63: 3915-3919
- ↑ DasSarma, Shiladitya (2007. november 23.). „Extreme Microbes”. American Scientist 95 (3), 224–231. o. DOI:10.1511/2007.65.1024. ISSN 0003-0996.
- ↑ This paragraph taken directly from the Academic Dictionaries and Encyclopedias page on Halobacterium
- ↑ DasSarma, Shiladitya: Extreme Halophiles Are Models for Astrobiology. [2007. február 2-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2007. március 17.)
