נולד באזמיר ללאה, בתו של רבי יהושע אברהם קריספין, רבה של איזמיר ולרבי חיים בנימין פונטרימולי, מחבר ספר פתח הדביר והיה בנו הבכור. למד את תורתו מפי רבי משה חודארה. לימד תלמידים רבים ועשה "מגדיים תיישים"[1]. כיהן כדיין יחד עם הרב אברהם פאלאג'י. היה ידוע כעניו גדול, שהיה שותק רוב ימיו, ואיש מעולם לא שמע אותו מדבר בקול רם, והדבר נראה גם בכתביו:
" ...ומזה תשכיל שעם שהרוח אין בו ממש, ואינו נראה לעין, על כל זאת הוא תקיף וחזק מאוד מפרק הרים ומשבר סלעים, ועתה יגדל נא כח הדיבור בעיניך, שהגם שאין בו ממש ואינו כלום, יש בו כח להזיק מאוד
— פני יוסף, פרשת טהרה, דף קכ"ה ע"א
מסופר עליו שהיה בקי גדול בדברי הגמרא והפוסקים עד שידע את ספר הטור ואפילו את ספר אורים ותומים, בעל פה. אביו, בעודו כותב את ספרו הנחשב פתח הדביר היה נושא ונותן עמו "על כל אות ואות", וכך גם בדינים קשים שהגיעו לפתחו היה מתייעץ תמיד עם בנו[1].
נפטר בכ"ד באבה'תר"ל (1870), חודש לאחר אחיו, רבי רפאל חייא פונטרימולי ובחיי אביו. רבי אברהם פאלאג'י הספידו באזמיר בק"ק צונצין מחזיקי תורה בשבת השבעה שלו וכתב עליו[2]:
נאבד מאיתנו המאיר את העיניים, חפץ יקר ואבידה שאינה חוזרת שהיה חכם מובהק ושלם במידות ובדיעות..עסוק בתורה תדירא ולא מחזיק טיבותא לנפשיה משים עצמו כמי שאינו..אין אנו מוצאין חליפתו ותמורתו ללמוד תלמידים בעיון רב...
משפחתו
אשתו לונה, הייתה בתו של הגביר הרב רפאל אברהם ליאון (תקס"ד-תרמ"ג), מציג הולנד באיזמיר ולאחר מכן בחיפה.