בדצמבר 2016 ביקר ארננדס בירושלים, ונפגש עם ראש ממשלת ישראלבנימין נתניהו. במהלך הפגישה נחתמו מספר הסכמי הגנה וביטחון דו-צדדיים בין המדינות, ושר הביטחון אביגדור ליברמן ושר ההגנה של הונדורס חתמו על הצהרה לשיתוף פעולה ביטחוני בין המדינות[10]. במאי2017 פרצה שערורייה לאחר שאשתו של הנשיא, אירושקה אלביר, אמרה בראיון לעיתון אל הרלדו כי "היטלר היה מנהיג גדול". לאחר מכן, היא פרסמה מכתב המופנה לקונגרס היהודי של אמריקה הלטינית, בו התנצלה והסבירה כי מעולם לא אמרה שהיטלר "עשה משהו טוב" אלא רק ציינה את "תכונות המנהיגות שלו"[11].
ב-24 במרץ2019, הכריז נשיא הונדורס על הכרת ארצו בירושלים כבירת ישראל ועל פתיחה של נציגות דיפלומטית של ארצו בשטחה[14]. ב-1 בספטמבר באותה שנה הגיע לביקור בישראל על מנת לחנוך את המשרד המסחרי של הונדורס בירושלים[15]. לאחר פחות מחודשיים, ב-2 בדצמבר דווח כי שגרירות הונדורס צפויה להיות מועברת לירושלים, ובמקביל שגרירות ישראל צפויה להיפתח מחדש בטגוסיגלפה, בירת הונדורס, וזאת בפעם הראשונה מאז 1995, לאחר שנסגרה בשל קיצוצים בתקציב משרד החוץ במהלך השנים[16].
ב-24 ביוני 2021 נחנכה שגרירות הונדורס בירושלים במעמד הנשיא חואן אורלנדו ארננדס[1]. במהלך ביקורו של ארננדס ערך פגישה עם ראש הממשלה נפתלי בנט, לצד פגישה של שרי החוץ של שתי המדינות, עובדי הממשל הנשיאותי ומחלקת המיסים של הונדורס. בסיומן נחתמו הסכמים דו-צדדיים בתחום החקלאות, ניהול המים, שירותי הבריאות, החינוך וחילופי מידע בפיתוחים חדשניים בין הונדורס לישראל[19].
לאחר שסיומרה קסטרו החלה לכהן כנשיאת הונדורס בינואר2022 היחסים בין המדינות נהיו פחות טובים. באוגוסט 2022 ממשלת הונדורס החדשה שקלה להעביר את השגרירות בישראל מירושלים לתל אביב[20]. ב-4 בנובמבר2023, במהלך מלחמת חרבות ברזל, הונדורס החזירה את השגריר שלה בישראל להתייעצויות בטענה ל"הפרות של המשפט ההומניטרי הבינלאומי שישראל מבצעת ברצועת עזה".
ידיעה על אירוע לציון יום השנה ה-76 להגעתה של אניית המעפילים אקסודוס לנמל חיפה, אירוע שקיימו קונסול הכבוד של הונדורס, אלכס פרננד, ושגרירות הונדורס בישראל, במוזיאון הימי הלאומי בחיפה
.jpg)
