נולד בקיימברידג'אנגליה כאשר אביו שהה שם בשנת שבתון. אביו, פרופ' יצחק גרנות היה פרופסור לכימיה במכון הביולוגי בנס ציונה, ואמו רות לבית זקס הייתה בעלת תואר שני בכימיה ועבדה כמורה לכימיה בבית ספר. לגרנות אח אחד. למד בתיכון בקריית החינוך ע"ש אהרן קציר ברחובות.
בשנים 1990–1992 שירת שרות חובה בצבא.
לאחר שירותו הצבאי למד באוניברסיטה העברית בירושלים לתואר ראשון, שני ושלישי. בשנים 1993-1996 למד לתואר ראשון בפיזיקה ובמתמטיקה וסיים את לימודיו בהצטיינות. בשנים 1996–1998 למד לתואר שני בפיזיקה וסיים גם לימודים אלה בהצטיינות. את עבודת התיזה שעסקה בעקומות אור, ספקטרום ודמויות של הזוהר שאחרי בהבזקי קרינת גמא כתב בהנחיית פרופ' צבי פירן.[1] בשנים 1998–2001 למד לתואר שלישי. את עבודת הדוקטור שעסקה בזוהר שבעקבות הבזקי קרינת גמא, כתב שוב בהנחיית פרופ' צבי פירן.[2]
גרנות פרסם יותר מ־170 מאמרים מדעיים בתחומי התמחותו. להלן מבחר מהם:
Granot, Jonathan; Panaitescu, Alin; Kumar, Pawan; Woosley, Stan E (2002). "Off-Axis Afterglow Emission from Jetted Gamma-Ray Bursts". The Astrophysical Journal. 570 Issue 2: L61–L64. doi:10.1086/340991. (המאמר עוסק בקרינת הזוהר שבעקבות התפרצויות גמא מסילונים הנצפים הרחק מציר הסימטריה שלהם).
Granot, Jonathan; Königl, Arieh (2003). "Linear Polarization in Gamma-Ray Bursts: The Case for an Ordered Magnetic Field". The Astrophysical Journal. 594 Issue 2: L83–L87. doi:10.1086/378733. (המאמר עוסק בקיטוב קווי של התפרצויות גמא: ההשלכות של שדה מגנטי סדור).
Granot, J; Guiriec, S; Ohno, M; Pelassa, V (2009). "A limit on the variation of the speed of light arising from quantum gravity effects". Nature. 462 (7271): 331–334. doi:10.1038/nature08574. (המאמר, שנכתב בשיתוף עם חוקרים רבים מלבד ארבעת הכותבים הראשיים הנזכרים, עוסק בחסם על התלות של מהירות האור בריק באורך הגל היכולה לנבוע מכבידה קוואנטית).
Granot, Jonathan; Komissarov, Serguei S; Spitkovsky, Anatoly (2011). "Impulsive acceleration of strongly magnetized relativistic flows". Monthly Notices of the Royal Astronomical Society. 411 (2): 1323–1353. doi:10.1111/j.1365-2966.2010.17770.x. (המאמר עוסק בהאצה מגנטית אימפולסיבית של זרימות יחסותיות).
Granot, Jonathan; Gill, Ramandeep; Younes, George; Gelfand, Josef; Harding, Alice; Kouveliotou, Chryssa; Baring, Matthew G (2017). "Learning about the magnetar Swift J1834.9-0846 from its wind nebula". Monthly Notices of the Royal Astronomical Society. 464 (4): 4895–4926. doi:10.1093/mnras/stw2554. (המאמר עוסק בתובנות על המגנטאר Swift J1834.9-0846 מתוך ערפילית הרוח שלו).