ב-1980 החליט חבר הקונגרס הרפובליקני המכהן טים לי קרטר, נציג המחוז החמישי של קנטקי בבית הנבחרים, לפרוש מהחיים הפוליטיים. רוג'רס זכה בבחירות המקדימות שנערכו במפלגה הרפובליקנית ברוב של 23% מהקולות, וביום הבחירות הכלליות גבר על יריבו הדמוקרטי ונבחר לראשונה לקונגרס של ארצות הברית. מאז הוא ניצח בכל הבחירות לקונגרס שנערכו אחת לשנתיים עם רוב גדול של מעל 70% באופן עקבי, כשהאחרונות בהן ב-2022, עם תמיכה של לפחות 82% מקולות הבוחרים, למעט ב-1992, כאשר גבר על חבר הסנאט של קנטקי כשקיבל 55% מהקולות. רוג'רס הוא בעל התפקיד הפדרלי בעל הכהונה הארוכה ביותר המייצג את קהיליית קנטקי. הוא מייצג את אחד ממחוזות הקונגרס הנחשבים לרפובליקניים מבחינה שורשית השוכנים דרומית לנהר אוהיו. דרום-מרכז קנטקי, לבו של המחוז, דומה מאוד מבחינה דמוגרפית למזרח מדינת טנסי. בוחריו הזדהו עם הרפובליקנים לאחר מלחמת האזרחים האמריקנית ותמכו במפלגה הרפובליקנית מאז ועד ההווה. רוג'רס היה ציר במספר כינוסים של הוועדה הרפובליקנית הלאומית.
בשנים 2011–2017 כיהן רוג'רס כיושב ראש ועדת ההקצבות, מהוועדות המשפיעות ביותר בבית הנבחרים של ארצות הברית. כיו"ר הוועדה, שם לו כיעד את צמצום גודל והיקף הממשל הפדרלי תוך ריסון הוצאות כלכליות פדרליות, ניהול פיקוח קפדני על סוכנויות ממשלתיות, ופעילות להשבת "המשמעת הפיסקלית" והשקיפות בתהליך קביעת תקציב המדינה. רוג'רס הוביל את הקונגרס לצמצם את ההוצאות הפדרליות באמצעות קיצוץ של 126 מיליארד דולר אמריקני מאז 2010. במהלך כהונתו, ניהל רוג'רס 650 שימועים בנושא פיקוח ולמעלה מ-2,000 תיקונים להצעות חוק בנושא הקצבות ממשלתיות במליאת בית הנבחרים. בשל עמדתו הבכירה בבית הנבחרים ועמדותיו השמרניות, רוג'רס נתון לביקורות רבות מצד חוגים ליברליים ופרוגרסיביים כאחד בשל סדרי העדיפויות שלו בכל הקשור לביטחון לאומי. כתב העת "National Review" כינה אותו "ביזיון לאומי", והמגזין רולינג סטון מנה אותו בין "עשרת חברי הקונגרס הגרועים באמריקה", והגדירו כ"החבר הטוב ביותר של אוסאמה בן לאדן" בגין הכוונת כספי ביטחון המולדת הפדרליים הרחק מערים גדולות אל יישובים במחוז הקונגרס שלו, אשר מבקריו טוענים כי מחוזו הוא אחד מיעדי הטרור הפחות סבירים באמריקה בגלל היעדר במונומנטים ייחודים או במרכזי אוכלוסייה בולטים[4].
לרוג'רס שלושה ילדים מאשתו הראשונה, שירלי מקדוול, לה היה נשוי מ-1958 עד למותה כתוצאה ממחלת הסרטן ב-1995. ארבע שנים מאוחר יותר נישא בשנית לסינת'יה דוייל[5].