אראקי ביים את סרטו הראשון, Three Bewildered People in the Night, בשנת 1987, בתקציב של 5,000 דולר בלבד. שנתיים לאחר מכן, בשנת 1989, אראקי כתב, הפיק, ביים, צילם וערך בעצמו את סרטו השני, The Long Weekend (O' Despair).
בשנת 1992, סרטו The Living End, העוקב אחר שני גברים נשאי HIV היוצאים יחד למסע דרכים, הוקרן בהקרנת בכורה בפסטיבל סאנדנס.
שלושת סרטיו הבאים של אראקי, "דפוק לגמרי", "דור מזוין" ו"שום מקום", מרכיבים את "טרילוגיית האפוקליפסה לנוער". בסרטים אלה החל אראקי לעבוד עם שחקנים ושחקניות מוכרים יותר, ביניהם רוז מק'גוון, פארקר פוזי, ראיין פיליפה והת'ר גראהם, והם קיבלו ביקורות מעורבות, החל ממבקר הקולנוע רוג'ר איברט שהעניק לסרטים אפס כוכבים ועד למגזין רוקי שהכריז על הסרטים כ"דבר הטוב ביותר אי פעם".[2][3]
לאחר מכן קיבל אראקי הצעה להפיק סדרת נוער בשם עבור ערוץ הטלוויזיהMTV בתקציב של מיליון וחצי דולר, אראקי ראה בהצעה הזדמנות להגיע לקהל גדול והסכים לה אף על פי ש-MTV הורידו את התקציב לשבע מאות אלף דולר, אך אחרי שאראקי כתב, ביים וצילם פרק פיילוט לסדרה "כך יגיע העולם לסופו". MTV החליטו לבטל את הפרויקט.[4]
בשנת 2004 הוקרן סרטו הבא של אראקי, עור מסתורי, בהקרנת בכורה בפסטיבל הסרטים של ונציה. הסרט מתאר את סיפורם של שני ילדים בגיל ההתבגרות, שעברו התעללות מינית מצד מאמן הבייסבול שלהם בילדותם. הסרט התקבל באהדה רבה בקרב המבקרים וזכה במספר פרסים ברחבי העולם, ובשנת 2007 יצא לאקרנים סרטו הבא של אראקי, "סמיילי פייס" סרט קומדיה בכיכובה של אנה פריס. המעבר החד מדרמה אפלה לקומדיה קלילה תוכנן במכוון בידי אראקי, והסרט "סמיילי פייס" זכה אף הוא לאהדת המבקרים.
בשנת 2010 הוקרן סרטו העשירי של אראקי, קאבום, בהקרנת בכורה בפסטיבל קאן והיה לסרט הראשון שזכה בפרס הסרט הקווירי בפסבטיבל.[5]