הכנסייה מהווה קהילה מלכותית מיוחדת (אנ'), כלומר נתונה ישירות תחת סמכות הכתר הבריטי. הגוף הכנסייתי המנהל את הקפלה מאז ייסודה הם הדיקן והקאנונים של וינדזור (אנ').
הקפלה הורחבה פעם נוספת בימי מלכותה של המלכה ויקטוריה במאה ה-19. בראשית המאה ה-20 נמצאו חלקים רבים מהקפלה במצב רעוע, וב-1920 החל פרויקט שיקום נרחב שלה, שארך עשר שנים.
התוספת האחרונה לקפלה הייתה הקמת קפלת הזיכרון למלך ג'ורג' השישי - למעשה, מרתף קבורה - הצמודה לחזית הצפונית של הקפלה. היא הוקמה בהזמנת המלכה אליזבת השנייה ונחנכה בשנת 1969.
חברי מסדר הבירית מתכנסים בווינדזור בחודש יוני לטקס שנתי, שחודש בשנת 1948 על ידי המלך ג'ורג' השישי במלאת 600 שנה לייסוד המסדר. הם צועדים בתהלוכה אל הקפלה בבגדיהם הטקסיים ומקיימים בה טקס דתי. לכל אחד מחברי המסדר ניתן מקום קבוע בקפלה, ולוחית מיוחדת מציינת את מיקומו. מעליו מוצגת ההרלדיקה האישית שלו, ובראשה דגל המסדר שלו, הנושא את שלט האצולה האישי של החבר. לאחר מות החבר במסדר מקיימים טקס ובמסגרתו מסירים את ההרלדיקה שלו ממקומה, למעט הלוחית, הנותרת במקומה. בקפלה מצוי אוסף של 800 לוחיות של חברי המסדר מאז ייסודו.
הקפלה היא מקום קבורתם של 11 ממלכי אנגליה והממלכה המאוחדת ושל עשרות בני משפחות המלוכה שלהם. עשרות אישים נוספים נקברו בקפלה והועברו ממנה לימים למקומות קבורה אחרים, ביניהם בית הקברות המלכותי, פרוגמור, לא הרחק מהקפלה.
קברי האישים ממוקמים באתרים שונים בקפלה, וביניהם ליד המזבח, במרתף הקבורה המלכותי (Royal Vault), בקפלת הזיכרון לנסיך אלברט, ליד הדלת המערבית, ובקפלת הזיכרון למלך ג'ורג' השישי. בקפלה זו נקברה המלכה אליזבת השנייה בשנת 2022. עמה קבורים שם הוריה, המלך ג'ורג' השישי ורעייתו אליזבת המלכה האם, אחותה הנסיכה מרגרט ובעלה הנסיך פיליפ.