טאבע בת רבי אריה לייביש ליפשיץ, דבורה בת רבי מרדכי זילברשטיין מהולשיץ, בריינדיל בת רבי יהודה צבי הירש אייכנשטיין מראזלא, חנה רחל בת הרב צבי הירש רמר"ז, שיינדיל בת הרב אברהם גבירצמן מגורליץ
מזיווג ראשון: דרעזיל, רבי נפתלי. מזיווג שני: חיה שרה, רבי משה משינאווא. מזיווג רביעי: מרים מלכה, פייגא ביילא, רבי אברהם שלום מסטרופקוב, רבי אריה לייביש מטארנא, רבי שמחה ישכר בער מצישינוב
כשנפטרה אשתו, לאחר תשע שנים נישא לאחייניתה, ממנה התאלמן לאחר שבע שנים, ונישא עוד שלוש פעמים. בסך הכול נולדו לו תשעה ילדים. מנהגו היה לנסוע להרבה צדיקים חלק מהם לפגושם ולהכירם וחלק לקבל אותם עליו להיות לו למורים ורביים, אם זאת רבותיו המובהקים היו רבי אשר ישעיה מרופשיץ, רבי צבי הירש מרימנוב והשר שלום מבעלז.
כיהן כרב ברודניק ובשנת תר"ח (1848) מונה לרב ברוזדול. לאחר מכן שימש כרב בשינובה, אחר כך בסטרופקוב ובצאנז לאחר פטירת אביו. לאחר מכן חזר לשינובה בה כיהן באדמו"רות ושם נודע לפועל ישועות. הוא נודע בקנאותו לאמת ובדקדוקו בהלכה, מאפיינים אלו היו בין הסיבות לכך שהיה לפעמים חולק אפילו על אביו בהלכה ובענייני הכלל. כמו אביו הצטיין גם הוא בתפילה נלהבת וסוערת.
דברי תורתו נאספו בספר "דברי יחזקאל" על ידי תלמידו רבי עקיבא הכהן ליבער מיאשניצא. הספר יצא לראשונה בשנת תרס"א. בספר יש תורות על התורה, חגים, תהלים, משלי, שיר השירים, תפילות, שבת, מסכת אבות, אגדות, אמירת תורה, מדרש רבה, וכן הערות שכתב על המשניות, גמרא, שו"ע, וספר 'בנאות דשא'. בסוף מצורפות מספר טיוטות של תשובות בהלכה ששלח (הטיוטות נשמרו אצלו מכיוון שהיו בהן טעויות[3]). רבי יחזקאל לא אמר תורה בקביעות שכן הוא לא אמר תורה אלא אם כן "שקל במאזני צדק ובהתבודדות מחשבתו הקדושה ובדבקות רב ועצום, ונודע אשר לא הגיד כי אם את אשר נשלח לו מן השמים בלתי לה' לבדו", כדברי בניו בהקדמתם לספר. הספר כמו מחברו נערץ ונקדש בעיני הצדיקים עד כדי שמובא בספר קדושת אהרן
" שמעתי מהגאון הצדיק רבי חיים מאיר שפירא מנרול [ששמע] מפי מרן האדמו"ר הקדוש מוהר"ר אהרן מבעלזא זצוק"ל, [וזה לשון קודשו] יעדיס ווארט פין ספר "דברי יחזקאל" [מהגה"ק משינאווא] איז מלא רוח הקודש {כל מילה\אימרה בספר דברי יחזקאל מלאה ברוח הקודש}".
רבי יחזקאל הוציא לאור את הספרים 'אור החמה' (פירוש לזוהר המהווה חלק שני מספר 'קריית ארבע' של ר' אברהם אזולאי) בשנת תרנ"ז ו'זהרי חמה' (ספר של ר' אברהם אזולאי המהווה קיצור של פירוש הזוהר של ר' אברהם גאלאנטי בשנת תרמ"א.
ילדיו
מאשתו הראשונה טאבע, בת רבי אריה לייביש ליפשיץ:
דרעזיל, אשת הרב פנחס תאומים-פרנקל רב בבוקאווסק ובצישינוב (נינו של הברוך טעם חמיו של רבי חיים מצאנז).
הרב נפתלי הלברשטאם (י"ד בחשווןתקצ"ח - כ"א בכסלותרכ"ד). בזיווג ראשון חתנו של רבי אהרן מרימנוב (בן רבי אשר ישעיה מרופשיץ) ובזיווג שני חתנו של רבי משולם זושא חתן רבי יעקב ישראל מצ'רקס. אביו הוציא את דברי תורתו בספר "איילה שלוחה".
מאשתו השנייה דבורה בת גיסו הרב מרדכי זילברשטיין רבה של הולשיץ (חתן רבי אריה לייביש ליפשיץ):
חיה שרה אשת הרב אלעזר בינדיגר משינאווא בנו של רבי שמואל זנוויל בינדיגר מברדיוב חתנו של רבי נפתלי מליז'ענסק. היא הייתה אימו של הרב אלימלך בינדיגר, שהיה אדמו"ר מדעש.