בשנת 1926 עבר פיטרי לחפור בארץ ישראל, סטרקי הצטרף אליו כעוזרו הראשי לחפירתו בתל ג'מה,[1] שם הביא לידי ביטוי את ניסיונו בניהול חפירה אשר צבר במצרים. הוא היה שותף לחפירותיו של פיטרי בתל אל פארעה (הוא ניהל את עונת החפירות האחרונה), וכן היה עוזרו של פיטרי בחפירה בתל אל-עג'ול.
חפירת תל לכיש
ב-1932 עזב סטרקי את פיטרי כדי לנהל בעצמו חפירה. הוא בחר לחפור בתל אֶ דֻוֵיר אשר זוהתה לאחר מכן כלכיש המקראית, עיר חשובה בממלכת יהודה. חברו אליו הארכאולוגים אולגה טפנל וג'רלד לנקסטר הרדינג שעבדו לצידו עד אז בחפירותיו של פיטרי. החפירות בתל לכיש התנהלו עד שנת 1938. הממצאים העיקריים כללו מקדש מתקופת הברונזה המאוחרת, פיר גדול, קיר חיצוני מדופן, שער העיר, בנין מנהלי גדול מתקופת ממלכת יהודה ומקדש השמש מהתקופה הפרסית והליניסטית. אחד הממצאים החשובים ביותר שלו היו "מכתבי לכיש" אשר נתגלו בעונת החפירות השלישית בשנים 1934-1935. מכתבי לכיש הם אוסטרקונים ועליהם כתובת בכתב העברי הקדום. הם נתגלו בחדר קטן בשער העיר בשכבה II, שככל הנראה נשלחו אל מפקד לכיש ערב כיבוש העיר בידי נבוכדנאצר מלך בבל. מכתבי לכיש נחשבים לתגלית שהרחיבה את הידע ההיסטורי של תקופות הכיבוש הבבלי.
רצח סטרקי
ב-10 בינואר1938 יצא סטרקי בדרכו לירושלים להשתתף בטקס הפתיחה של תצוגת הקבע של מוזיאון רוקפלר. בסביבות השעה 5.00 אחר הצהרים בנוסעו במכוניתו הנהוגה על ידי נהגו ובה גם שני עוזרים ערבים, נעצרה המכונית בהיותה בקרבת הכפר בית ג'יברין, ליד הכביש הראשי בית גוברין - חברון, על ידי כנופיית ערבים חמושים. סטרקי נשאל לזהותו, בענותו כי הוא בריטי, נדרש לרדת ממכוניתו. שני עוזריו הערבים שולחו ללא פגע ונהגו נדרש לנסוע לחברון. כשהנהג הרחיק מעט בנסיעתו הוא שמע שתי יריות וכשהסב ראשו לאחור ראה את סטרקי נופל ארצה. הנהג הודיע על המקרה למשטרת חברון והשוטרים יצאו למקום וגילו את גופתו של סטרקי כשהוא ירוי בשני כדורים בראשו[2][3]. בעקבות הרצח נדחתה פתיחת מוזיאון רוקפלר ביומיים וטקס הפתיחה החגיגי שהנציב העליון היה אמור להשתתף בו, בוטל[4].
הכנופיה שרצחה את סטרקי הייתה הכנופיה הגדולה ביותר באזור חברון ובראשה עמד רוצח שברח מבית הכלא. הרצח זעזע את היישוב, אשר היה מודע לתגליותיו של סטרקי שנתפרסמו בעיתונות העברית. סטרקי נבחר להתנקשות בשל היותו אישיות בריטית, וזאת במהלך התקופה שלאחר רציחתו של מושל הגליללואיס אנדרוס, בסוף שנת 1937, שבה הפרו הערבים לראשונה הסכם לא כתוב, שהתקיים מאז ראשית המאורעות, שלא להתנקש באנשי שלטון ואישים בריטיים. סטרקי הובא לקבורה בבית הקברות הפרוטסטנטי בהר ציון.