נגרדו נולד במדריד, והחל את הקריירה שלו במועדון הכדורגל המקומי ראיו ואיקנו. לאחר ששיחק בקבוצת הנוער ובקבוצת המשנה של המועדון, ערך את הופעת הבכורה שלו בקבוצה הבוגרת בשנת 2005 בליגה הספרדית השנייה. בקיץ של אותה השנה עבר לריאל מדריד ושיחק והתאמן בקבוצת המשנה של המועדון – ריאל מדריד קסטיליה.
בעונת 2006/2007 כבש 18 שערי ליגה במדי ריאל מדריד קסטיליה. אך אלו לא הצליחו למנוע את ירידת קבוצתו לליגה השלישית. הוא הצליח לצוד את עינו של מאמן הקבוצה הראשונה, פאביו קאפלו, ונכלל בסגל הקבוצה במספר משחקים במסגרת גביע המלך הספרדי אך נשאר על ספסל המחליפים.
אלמריה
ביולי2007 נמכר לאלמריה מהליגה הראשונה כשבחוזה ההעברה נשארת לריאל מדריד אפשרות לרכוש אותו מחדש. הוא ערך את הופעת הבכורה שלו במועדון ב-26 באוגוסט 2007 בניצחון אלמריה 0–3 על דפורטיבו לה קורוניה, וב-2 בפברואר 2008 כבש שער מכדור עונשין מ11 מטרים במשחק ביתי נגד קבוצתו לשעבר שהפסידה לאלמריה 2:0. נגרדו סיים את העונה כמלך השערים באלמריה לאחר שכבש 13 שערים, והקבוצה מחבל אנדלוסיה סיימה במקום השמיני. בעונת 2008/2009 כבש חמישה שערים בששת המשחקים הראשונים של הקבוצה, בתוכם שער ניצחון בתוספת הזמן נגד רקראטיבו ולבה ב-28 בספטמבר 2008. את העונה הוא סיים עם 19 שערים וריאל מדריד בחרה לממש את זכותה ולרכוש אותו מחדש תמורת חמישה מיליון יורו. הוא חזר להתאמן בריאל מדריד בקיץ 2009 והשתתף במשחקי ההכנה של הקבוצה אך לא המשיך במועדון בעונת 2009/2010.
סביליה
נגרדו החליט לעבור לסביליה בה חתם על חוזה לחמש שנים. סביליה שילמה עליו 15 מיליון יורו, וכמו במקרה אלמריה, ריאל מדריד סיכמה מראש על אפשרות לרכישתו בחזרה בשנתיים הבאות. הוא ערך את הופעת הבכורה שלו בסביליה ב-31 באוגוסט 2009 במשחק נגד ולנסיה ועלה כמחליף בדקה ה-37 בהפסד חוץ 0–2. כעבור שבועיים כבש שער בכורה במשחק חוץ נגד אוסאסונה בניצחון 0–2. בעונתו הראשונה בסביליה, עונת 2009/2010, התחרה על עמדת החלוץ עם לואיס פביאנו ופרדי קאנוטה. בסך הכול כבש 11 שערים בעונה זו והיה שותף לזכיית הקבוצה בגביע המלך. בעונת 2010/2011 ביסס את מקומו כחלוץ הפותח של סביליה כשכבש 27 שערים בכל המסגרות, 20 מתוכם בליגה, וזכה בגביע זארה המוענק מדי עונה לכדורגלן הספרדי שהבקיע הכי הרבה שערים בליגה (מלך השערים בעונה זו היה כריסטיאנו רונאלדו הפורטוגזי). בעונת 2012/2013 כבש 25 שערים וזכה שוב בגביע זארה.
מנצ'סטר סיטי
ב-19 ביולי2013 נמכר תמורת 20 מיליון אירו למנצ'סטר סיטי וחתם על חוזה לארבע עונות. את הופעת הבכורה שלו במדי מנצ'סטר סיטי הוא ערך ב-19 באוגוסט 2013, כשעלה כמחליף בניצחון 0–4 על ניוקאסל באצטדיון סיטי אוף מנצ'סטר. את שערו הראשון כשחקן הסיטי כבש במשחק הבא, בנגיחה בהפסד 2–3 מול העולה החדשה קרדיף סיטי. בסך הכול כבש בעונתו הראשונה תשעה שערי ליגה ו-23 בכל המסגרות, והיה שותף לזכיית הקבוצה באליפות אנגליה, בגביע הפוטבול ליג ובהעפלתה לשמינית גמר ליגת האלופות.
ולנסיה
ב-1 בספטמבר2014 הושאל לוולנסיה.[1] ערך את הופעתו הבכורה בקבוצה ב-25 באוקטובר בניצחון 1–3 על ויאריאל. הבקיע את שערו הבכורה בקבוצה נגד אספניול בפנדל בניצחון 1–2 בגביע. בקיץ תמה השאלתו, אך הוא הועבר באופן מלא לוולנסיה. בשתי עונותיו בקבוצה הבקיע 18 שערים בכל המסגרות.
מידלסברו
ב-20 ביולי2016 הושאל למידלסבורו. ב-13 באוגוסט ערך את הופעתו הבכורה בקבוצה בתיקו 1-1 נגד סטוק סיטי בו הבקיע את שערו הראשון. נגרדו כבש תשעה שערים בליגה אך קבוצתו ירדה בסיום העונה.
