העובדה שקמפוס האוניברסיטה מחולק למעשה בין שתי ערים, ונהר מפריד ביניהן, מצריכה היערכות לוגיסטית מיוחדת של האוניברסיטה. ה־Gopher Way מקשרת בין רוב מבני כיתות הלימוד, במערכת רחבה ומסועפת ומאגדת מבנים במתחמים נפרדים בשתי גדותיו של נהר המיסיסיפי, המשלבת גם כמה מעברי־על בין המבנים, כך שלעיתים נדרשים ההולכים בנתיביה לעלות עד לקומה ה־5 כדי לעבור בין הבניינים. בנוסף, האוניברסיטה מפעילה קו אוטובוס חינם בין שני חלקי קמפוס האוניברסיטה, הנמצא בשתי הערים.
בשנת 2024, מינסוטה דורגה כאוניברסיטה ה־26 הטובה ביותר בארצות הברית על ידי הדירוג האקדמי של האוניברסיטאות בעולם.[5] תוכנית התואר הראשון של מינסוטה דורגה במקום ה־68 מבין האוניברסיטאות הלאומיות לפי US News and World Report לשנת 2022, ובמקום ה־26 במדינה בקרב קולג'ים ואוניברסיטאות ציבוריות.[6]
החל מקבלת הדוקטורט שלו מאוניברסיטת מינסוטה ב־1942, פעל נורמן בורלוג לחקר החקלאות ונחשב ל"אבי המהפכה הירוקה". בורלוג זכה ב־1970 בפרס נובל לשלום על מחקריו ופעילותו לצמצום הרעב העולמי.
בשנות ה־80 ביצע חוקר החוג לפסיכולוגיה תומאס בוצ'ארד (אנ') את אחד ממחקרי התאומים המקיפים ביותר, בו בחן את רמת ההתאמה בין תאומים זהים שגודלו בנפרד.