PROFILPELAJAR.COM

Estruturas proteicas dispoñibles:
Pfam	estruturas / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	resumo de estruturas
PDB	1sx3K:23-525 1kpoZ:23-525 1fyaA:190-375 1gruH:23-525 1xckF:23-525 1kp8E:23-525 1pcqJ:23-524 1aonJ:23-524 1mnfI:23-525 1svtJ:23-524 2c7dK:23-525 1dkdC:190-335 1j4zL:23-525 1oelE:23-524 2c7cH:23-525 1gr5H:23-525 1sx4E:23-524 1kid :190-375 1gr6F:23-525 1ss8B:23-524 1fy9A:190-375 1dk7A:190-335 1jon :190-335 1la1A:187-378 1iokA:23-526 1wf4e:22-526 1we3E:22-526 1sjpB:42-522 1srvA:1-143 1a6dB:33-521 1a6eB:33-521 1e0rB:215-366 1ass :214-364 1asx :214-364 1gn1H:210-380 1gmlB:210-380

Familia das chaperoninas TCP-1/cpn60
	Estrutura da chaperonina bacteriana GroEL.
Identificadores
Símbolo	Cpn60_TCP1
Pfam	PF00118
InterPro	IPR002423
PROSITE	PDOC00610
CATH	5GW5
SCOPe	1grl / SUPFAM
CDD	cd00309
Pfam
Estruturas proteicas dispoñibles:
Pfam	estruturas / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	resumo de estruturas
PDB	1sx3K:23-525 1kpoZ:23-525 1fyaA:190-375 1gruH:23-525 1xckF:23-525 1kp8E:23-525 1pcqJ:23-524 1aonJ:23-524 1mnfI:23-525 1svtJ:23-524 2c7dK:23-525 1dkdC:190-335 1j4zL:23-525 1oelE:23-524 2c7cH:23-525 1gr5H:23-525 1sx4E:23-524 1kid :190-375 1gr6F:23-525 1ss8B:23-524 1fy9A:190-375 1dk7A:190-335 1jon :190-335 1la1A:187-378 1iokA:23-526 1wf4e:22-526 1we3E:22-526 1sjpB:42-522 1srvA:1-143 1a6dB:33-521 1a6eB:33-521 1e0rB:215-366 1ass :214-364 1asx :214-364 1gn1H:210-380 1gmlB:210-380

As chaperoninas (Cpn) son unha familia de proteínas que proporcionan condicións favorables para o pregamento correcto doutras proteínas, impedindo así a súa agregación. Como impiden o pregamento incorrecto das proteínas, preveñen doenzas como a enfermidade das vacas tolas. As proteínas que se acaban de sintetizar xeralmente teñen que pregar a súa cadea linear de aminoácidos orixinal a unha forma en tres dimensións. As chaperoninas pertencen a unha gran clase de moléculas que axudan ao pregamento das proteínas, chamadas chaperonas moleculares ou, simplemente, chaperonas.^[2]^[3] Son proteínas de choque térmico que orixinalmente foron distinguidas pola súa masa molecular de 60 kDa, polo que se chamaron HSP60. A enerxía para o pregamento de proteínas fornécea o adenosín trifosfato (ATP). As proteínas chaperoninas poden tamén etiquetar proteínas mal pregadas para que sexan degradadas.

Estrutura

A estrutura destas chaperoninas lembra dous donuts un sobre o outro que crean un barril. Cada anel pode estar composto de 7, 8 ou 9 subunidades dependendo do organismo no cal se atopa a chaperonina. Cada cadea peptídica de ~60 kDa pode ser dividida en tres dominios: apical, intermedio e ecuatorial.^[4]

A chaperonina orixinal propúxose que evolucionou dunha peroxirredoxina.^[5]

Clases de chaperoninas

Grupo I

As chaperoninas do grupo I ou Cpn60^[6] encóntranse en bacterias e en orgánulos de orixe emdosimbiótica: cloroplastos e mitocondrias.

O complexo GroEL/GroES en E. coli é unha chaperonina do grupo I, que é o complexo de chaperonina grande (~ 1 MDa) mellor caracterizado.

GroEL é un dobre anel de 14mer (tetradecámero) cunha mancha hidrófoba na súa abertura e pode acomodar o pregamento nativo de substratos de 15 a 60 kDa.
GroES é un heptámero de anel simple que se une a GroEL en presenza de ATP ou análogos do estado de transición da hidrólise do ATP, como o ADP-AlF₃. É como unha tapa que cobre GroEL (caixa/botella).

GroEL/GroES é posible que non poida desfacer agregados de proteínas, pero cineticamente compite na vía do pregamento incorrecto e a agregación, polo que impide a formación de agregados.^[7]

Grupo II

Chaperonina II termosoma, hetero16mer, *Sulfolobus solfataricus*.

As chaperoninas do grupo II, que se encontran no citosol eucariota e en arqueas, están peor caracterizadas.

O TRiC (complexo do Anel TCP-1, tamén chamado CCT para chaperonina que contén TCP-1), a chaperonina eucariota, está composta de dous aneis de oito subunidades diferentes aínda que relacionadas, cada unha das cales se cre que está representada unha vez por cada anel de oito membros. O TRiC pensábase orixinalmente que pregaba só as proteínas citoesqueléticas actina e tubulina, mais agora sábese que prega ducias de substratos.

A Mm cpn (chaperonina de Methanococcus maripaludis), que se encontra na arquea Methanococcus maripaludis, está composta de 16 subunidades idénticas (oito por anel). Prega a proteína mitocondrial rodanase; porén, aínda non se identificou ningún substrato natural seu.^[8]

As chaperoninas do grupo II non se cre que utilicen un cofactor de tipo GroES para pregar os seus substratos, senón que conteñen unha tapa "integrada" que se pecha de maneira dependente do ATP para encapsular os seus substratos, un proceso que é necesario para a actividade óptima de pregamento de proteínas.

Outras familias

O grupo III comprende algunhas Cpns bacterianas que están relacionadas co grupo II. Teñen unha tapa, pero nelas a abertura da tapa non é cooperativa. Pénsase que son parentes antigas do grupo II.^[3]^[4]

A chaperonina do grupo I gp146 do fago EL non usa tapa e a súa interface de donut é máis similar á do grupo II. Podería representar outro tipo antigo de chaperonina.^[9]

Mecanismo de acción

As chaperoninas sofren grandes cambios conformacionais durante unha reacción de pregamento como función da hidrólise encimática de ATP e a unión a proteínas substrato e cochaperoninas, como GroES. Estes cambios conformacionais permiten que a chaperonina se una a unha proteína non pregada ou mal pregadan, encapsule dita proteína dentro dunha das cavidades formadas por dous aneis, e libere a proteína de novo na disolución. Despois da liberación, a proteína substrato vaise pregar ou precisará máis roldas de pregamento, para o cal pode unirse outra vez a unha chaperonina.

O mecanismo exacto polo cal as chaperoninas facilitan o pregamento de proteínas substrato descoñécese. De acordo con recentes análises por diferfentes técnicas experimentais, as proteínas substrato unidas a GroEL poboan un conxunto de estados compactos e expandidos localmente que carecen de interaccións terciarias estables.^[10] Propuxéronse varios modelos da acción das chaperoninas, que xeralmente se centran en dous papeis (non mutuamente exclusivos) do interior da chaperonina: pasivo e activo. Os modelos pasivos tratan a gaiola que forman as chaperoninas como unha forma inerte, que exerce a súa influencia ao reducir o espazo conformacional accesible para a proteína substrato ou impedindo as interaccións intermoleculares, por exemplo a prevención da agregación.^[11] O papel das chaperoninas activas é intervir en interaccións específicas chaperonina–substrato que poden ser acopladas a rearranxos conformacionais da chaperonina.^[12]^[13]^[14]

Probablemente o modelo máis popular do papel das chaperoninas activas é o mecanismo de annealing iterativo (IAM), que se centra no efecto da unión repetitiva de natureza hidrofóbica do substrato proteína coa chaperonina. De acordo con estudos de simulacións computacionais, o IAM orixina un pregamento máis produtivo ao causar o despregamento das conformacións mal pregadas do substrato^[14] ou ao impedir o pregamento incorrecto de proteínas cambiando a vía de pregamento.^[12]

Conservación da homoloxía funcional e estrutural

Todas as células conteñen chaperoninas.

En bacterias, o arquetipo é a chaperonina ben caracterizada GroEL de E. coli.
En arqueas, a chaperonina denomínase termosoma.
En eucariotas, as chaperoninas denomínanse CCT (tamén chamadas TRiC ou c-cpn).

Estes complexos de proteínas parecen ser esenciais para a vida de E. coli, Saccharomyces cerevisiae e os eucariotas superiores. Aínda que hai diferenzas entre as chaperoninas eucariotas, bacterianas e arqueanas, a estrutura xeral e o mecanismo están conservados.