Waris Hussein est né le à Lucknow dans l'état de Uttar Pradesh en Inde et grandit à Bombay. En 1947 la Partition des Indes forcera son père à partir au Pakistan tandis que sa mère, Attia Hossein, choisit de partir en Angleterre avec les enfants[1] et à partir de 1949, elle travaille comme scénariste et diffuseur pour la section indienne du BBC World Service[2].
Waris étudiera la littérature anglaise au Queens' College à Cambridge où il dirige quelques pièces de théâtre[3]. Il y croise des gens comme Derek Jacobi, Margaret Drabble, Trevor Nunn, and Ian McKellen[4], et se retrouve à les mettre en scène plusieurs fois notamment au club de théâtre des étudiants dans la pièce César et Cléopâtre de George Bernard Shaw[5]. Après sa remise de diplôme en 1960 il prend des cours pour être réalisateur à la BBC. Il change à l'occasion son nom de Habibullah vers Hussein : "Ca sonnait un peu comme le roi de Jordanie à l'époque, mais plus tard, cela sonna un peu plus comme Saddam Hussein, ce qui n'aide pas dans la vie."[6]
Hussein est connu pour être un des premiers ressortissant indien à travailler pour la BBC. Il est connu aussi pour avoir tourné le tout premier épisode de Doctor Who « An Unearthly Child » en 1963, même s'il n'était pas très sûr que la science-fiction serait une bonne chose pour sa carrière. Il dira "Je venais d'être diplômé de Cambridge avec les honneurs et je me suis retrouvé à réaliser ce téléfilm avec des types déguisés en homme des cavernes et j'ai pensé "où est-ce que j'ai atterri ?"[7] Il dirigera aussi en 1964 le 4e épisode de la série, « Marco Polo » avant de se diriger vers d'autres productions.
Il filme ainsi une adaptation de la Route des Indes (BBC, 1965), Notorious Woman (BBC, 1974), Shoulder to Shoulder (BBC, 1974) un téléfilm sur le mouvement des suffragettes et Edward and Mrs. Simpson (1978) pour Thames Television. Ces deux dernières production l'on vu retravailler avec la productrice des premiers épisodes de Doctor WhoVerity Lambert. Il dirigera aussi une histoire pour le programme de Thames Armchair Thriller.[8],[9],[10]
Dans les années 1990 il réalise plusieurs téléfilms aux États-Unis. En 1997 il réalise le film Sixth Happiness, selon un script de Firdaus Kanga avec Meera Syal, Nina Wadia et Firdaus Kanga elle-même[12].