Le Teatro San Moisè fut construit en 1620 par la branche San Barnaba de la famille Giustinian. La première production, en 1640, était l'opéra de Claudio MonteverdiL'Arianna (aujourd'hui perdu). Il passa ensuite dans les mains de la famille Zane et fut utilisé par la compagnie Ferrari. Le librettiste Giovanni Faustini fut l'un de ses premiers directeurs.
Au départ, c'était l'un des plus petits théâtres de Venise, mais aussi l'un des plus influents. En 1668 il fut agrandi à 800 places et par la suite, en 1674, il fut dirigé par Francesco Santurini, qui causa une révolution en réduisant de moitié le prix des billets, les abaissant à 2 lires, ce qui amena la multiplication des opéras et, par la suite, une prolifération dans la ville de théâtres en activité.
Cette tendance se poursuivit pendant la plus grande partie du siècle. Au cours des années 1770 et 1780 le théâtre fut sous le contrôle du prolifique librettiste Giovanni Bertati, le Poeta Cesareo (c'est-à-dire le Poète Impérial) de l'Opéra italien à Vienne, qui se concentra sur les drammi giocosi avec Pasquale Anfossi et d'autres compositeurs.
Le San Moisè ferma finalement après avoir produit une série de farse[1] de Rossini. Il devint d'abord un théâtre de marionnettes avant d'être reconstruit comme Teatro Minerva. Vers la fin du XXe siècle il était devenu pour partie un magasin et pour partie un bloc d'appartements.