Jesse est aujourd'hui âgé de 16 ans, tandis que l'orque Willy a fondé sa propre bande et coule des jours heureux dans le Pacifique, le long de la côte nord-ouest américaine. Menacé par des chasseurs, Willy pourra une fois encore compter sur l'amitié de Jesse et l'aide de Max, le fils de l'un de ces chasseurs pour échapper aux dangers qui planent sur lui et sa bande.
Fiche technique
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L'orque Keiko, vedette du film, est décédée à l'âge de 27 ans le des suites d'une pneumonie dans le fjordnorvégien d'Arasvik, près de Halsa. Un cairn indique l'emplacement où elle a été enterrée, sur la plage de Taknes.
La France n'a pas participé à la production du film, contrairement aux deux précédents, qui avaient été coproduits par Studiocanal.