Après un bon début de saison, marqué notamment par une victoire probante à domicile conte le champion sortant, Fleury Loiret, l'équipe occupe la deuxième place avant la trêve. Le club accepte à ce moment la demande de départ de l'entraîneur, Jérémy Roussel, qui souhaite rejoindre l'équipe masculine de Chartres[4]. Il est remplacé par Emmanuel Mayonnade, libre après le dépôt de bilan de l'Union Bègles-Bordeaux-Mios Biganos à l'automne 2015, qui signe un contrat de 18 mois[5].
Note : Est indiqué comme étant en sélection nationale toute joueuse ayant participé à au moins un match avec une équipe nationale lors de la saison 2015-2016.
Metz Handball termine 1er de la saison régulière. Le club est directement qualifié pour les demi-finales du championnat (playoffs).
Légende: VictoireNulDéfaiteScore du club
Avec une seule défaite, chez le champion sortant Fleury, et une série de onze victoires consécutives de septembre à février, Metz termine la saison régulière à la première place et se qualifie directement en demi-finale des play-offs pour affronter le vainqueur du quart entre Nice et Besançon[15].
Phase finale
En demi-finale contre l'OGC Nice, la rencontre aller est très serrée à l'image des deux rencontres de saison régulières entre les deux équipes. Metz concède le match nul après un arrêt décisif de Cléopâtre Darleux sur un pénalty d'Ana Gros à la dernière seconde[16]. Au retour aux Arènes de Metz, la rencontre tourne rapidement à l'avantage de Metz qui l'emporte de huit buts grâce à ses arrières Ana Gros (10 buts) et Xenia Smits (6 buts), ainsi qu'à Laura Glauser (11 arrêts à 40,7% de réussite)[17].
Pour la finale, Metz retrouve Fleury, champion en titre, qui l'a récemment éliminé en demi-finale de la Coupe de la Ligue française, pour l'affiche attendue entre les deux meilleures équipes du championnat[18]. Pour le premier match à Orléans, Metz remporte une courte victoire au terme d'un match accroché (24-23)[19]. Au retour, aux Arènes, Metz remporte devant son public le match retour (29-27) qui lui offre son 20e titre de champion de France. Ce match est notamment le dernier de la capitaine emblématique du club, Nina Kanto, qui prend sa retraite avec un 11e titre personnel[20].
Après avoir écarté Nantes aux Arènes (30-22), Metz Handball se présente face à Fleury en demi-finale lors du tour principal de la coupe de la Ligue. Les deux équipes, qui ont terminé aux deux premières places de la phase régulière du championnat, se retrouvent pour la troisième fois de la saison. Au cours d'un match intense et spectaculaire, c'est finalement Fleury qui s'impose (27-26) et rejoint Nice en finale[28].
↑À la suite du dépôt de bilan de l'Union Bègles Bordeaux-Mios Biganos en novembre 2015, les points obtenus face à cette équipe ne sont finalement pas comptabilisés dans le classement général. Source : « LFH : et maintenant, on fait comment? », sur handzone.net, .
↑Après le dépôt de bilan du Handball Club Nîmes après la fin de la phase régulière en mars 2016, un forfait général est prononcé et tous les résultats de Nîmes sont annulés. Les points obtenus face à cette équipe ne sont finalement pas comptabilisés dans le classement général. Sources : « Officiel – Forfait général pour Nîmes », sur handlfh.org, et « LFH : Nîmes forfait, les quarts de finale connus », sur handzone.net, .