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Fils de Francis Charles Merle d'Aubigné (1861-1948), président du Consistoire de l'Église réformée de Paris, il suit des études de médecine et devient chirurgien orthopédiste français, spécialiste de chirurgie réparatrice.
Membre de l'Académie de médecine (1965) et de l'Académie nationale de chirurgie, il devient membre de l'Académie des sciences en 1966 (section de médecine et chirurgie, puis section de biologie humaine et sciences médicales) et président de la Société française de chirurgie orthopédique et traumatologique.
