Le repêchage de la Ligue majeure de baseball 2016 se tient du 9 au . Il s'agit de la 52e présentation du repêchage amateur de la Ligue majeure de baseball, un événement annuel dont des équivalents sont présents dans tous les sports collectifs nord-américains, comparable à une bourse aux joueurs, où les équipes sélectionnent des sportifs issus de l'université ou de l'école secondaire.
Les sélections se font sur 40 rondes, chacun des 30 clubs choisissant à tour de rôle, et un total de 1 216 joueurs sont en 2016 repêchés[1]. Les sélections donnent le droit au club d'engager des négociations en vue de la signature d'un contrat.
En incluant les choix supplémentaires compensatoires, 41 joueurs sont choisis au premier tour de sélection.
Ordre de sélection
L'ordre du repêchage 2016 est déterminé par les classements de la saison 2015 de la MLB. La moins bonne formation, les Phillies de Philadelphie en l'occurrence, choisit la première et les 29 autres clubs sont classés en ordre décroissant selon leurs performances de la saison de baseball précédente. Si plusieurs clubs terminent avec la même fiche victoires-défaites, le club ayant remis la moins bonne fiche deux saisons plus tôt aura préséance sur les autres et choisira juste avant.
Choix compensatoires
L'ordre peut varier selon les sélections retirées ou attribuées selon le système de compensation prévu pour la perte de certains joueurs établis devenus agents libres durant l'intersaison. Lorsqu'un agent libre reçoit du club qu'il a la possibilité de quitter une offre formelle équivalente aux 125 plus hauts salaires de la saison qui se termine, puis signe avec un nouveau club, l'équipe amputée d'un joueur reçoit un choix compensatoire qui s'ajoute à la fin du premier tour normal de sélection. Le club ayant engagé le joueur perd sa sélection de premier tour seulement si celle-ci ne devait pas se faire dans les 10 premières[2].
Des choix de compensation peuvent aussi attribués aux clubs incapables de mettre sous contrat un joueur repêché l'année précédente. C'est le cas en 2016 des Dodgers de Los Angeles, qui reçoivent la 36e sélection au total de la première ronde pour avoir été incapable de signer leur premier choix de l'année précédente, Kyle Funkhouser[3].