Pendant des siècles, Bourgneuf, commune à laquelle était rattaché le Collet, fut un grand exportateur de sel produit dans les marais salants du littoral. À la fin du XVe siècle, plus de 200 navires chargent dans la baie de Bourgneuf (ou « baie de Bretagne ») à destination des ports de la mer Baltique, grands consommateurs pour leurs salaisons[1].
Le Collet est en fait l'avant-port de Bourgneuf qui était devenu trop ensablé. Cette activité assure une prospérité dont témoignent encore les dernières belles maisons d'armateurs construites à Bourgneuf-en-Retz. Le Collet était le premier port breton exportateur de sel, un commerce qui participa à l'essor économique du Duché de Bretagne.
Progressivement, l'envasement de la baie provoque la fin de l'exportation de sel à partir du Port du Collet (vers le XVIIIe siècle) et oblige les bateaux à chercher leur cargaison à Brouage (Charente-Maritime), puis à Setúbal (Portugal).
L'ancienne écluse (1879) a été détruite au début des années 2000, pour la construction d'une nouvelle environ 800 m plus en amont du Falleron. Le Port du Collet est apprécié des pêcheurs à la ligne, qui profitent de cette écluse pour ferrer anguilles et mulets. On compte au total une soixantaine de mouillages sur estacades. À l'embouchure du port prennent place de nombreuses pêcheries munies de larges carrelets, et ceci jusqu'au bourg des Moutiers-en-Retz.