L'année suivante, il ne joue que 13 matchs avec les Bruins avant d'être échangé aux Maple Leafs de Toronto avec Fern Flaman, Ken Smith et Leo Boivin contre Bill Ezinicki et Vic Lynn. Maloney joue peu avec les Maple Leafs au cours des saisons qui suivent, passant l'essentiel de sa carrière en ligues mineures. En 1954, il est vendu aux Canucks de Vancouver dans la Western Hockey League. En 1956, il est élu dans la première équipe d'étoiles de la WHL. Après un passage aux Black Hawks de Chicago et leur club-école les Bisons de Buffalo dans la LAH où il remporte le trophée Les-Cunningham du meilleur joueur de la saison, il revient dans la WHL avec les Canucks. C'est avec cette équipe qu'il termine sa carrière en 1970 après avoir remporté à trois reprises le trophée du meilleur joueur de la saison en 1956, 1962 et 1963.
Il prend sa retraite de joueur en 1970 puis devient entraîneur des Totems de Seattle dans la WHL et des Canucks qui ont intégré la LNH en 1970. Ses résultats à la tête de l'équipe étant moyens, il est remplacé au cours de la saison 1976-1977 par Orland Kurtenbach.