Malgré son nom, Pale Blue Eyes a été écrite à propos de quelqu'un dont les yeux étaient noisette, comme le note Reed dans son livre Between Thought and Expression[1]. La chanson aurait été inspirée par Shelley Albin, le premier amour de Reed, qui à l'époque était mariée à un autre homme[2].
La chanson est le fil rouge du film romantique The Contact de 1997, dans lequel un DJ de radio reçoit un colis anonyme contenant l’album The Velvet Underground et joue Pale Blue Eyes dans l’espoir de renouer avec son ancienne amante.
La chanson et la version LP de l'album ont toutes deux été présentées dans un épisode de la sitcom sud-coréenne 2009-2010 High Kick Through the Roof . Les personnages Shin Sekyung (Shin Se-Kyung) et Lee Jihoon (Daniel Choi) ont écouté la chanson à plusieurs reprises dans un bar à disques et un café que Jihoon avait souvent fréquentés à l'université. Plus tard, Sekyung a acheté le disque en souvenir; dans un épisode ultérieur, elle a donné le disque à Jihoon comme cadeau d'anniversaire.
The Killers ont rendu hommage à Lou Reed le jour de son décès en interprétant cette chanson lors de la première édition du festival Life is Beautiful à Las Vegas[7].
Aziz Ansari a utilisé cette chanson dans son émission télévisée spéciale pour Netflix 2019, Aziz Ansari: Right Now.
