Le musée est fondé le pour documenter, préserver et informer les visiteurs sur l'histoire de l'Architecture de l'Estonie et ses développements contemporains.
Le musée commence à fonctionner dans un local temporaire au 7 rue Kooli dans le centre historique de Tallinn et les collections sont entreposées dans la tour Loewenschede.
En 1996, le musée s'installe dans l'ancien entrepôt de sel Rotermann(et).
Le bâtiment est ouvert au public le [2].