Il rentre chez DC Comics, créa les superhéros Green Arrow & Aquaman en 1941 et arrête sa carrière pour partir à l'armée durant la deuxième guerre mondiale. Il est sergent et écrit des scénarios pour des émissions de radio.
De retour chez DC Weisinger devient responsable éditorial pour les comics de Superman.
Il engage le scénariste Otto Binder comme scénariste principal de l'homme d'acier. Binder, dans les années 1940 était le scénariste de Captain Marvel, le plus important concurrent de Superman, pour Fawcett Comics. Grâce à lui l'aspect science-fictionnel de la série est plus présent et de nombreux éléments importants du monde de Superman sont introduits comme la forteresse de la Solitude ou la kryptonite rouge. Par ailleurs, Weisinger décide d'ajouter une page dédiée au courrier des lecteurs dans les comics qu'il dirige et il en profite pour connaître les attentes de ceux-ci. À la suite de plusieurs propositions de lectrices désireuses de voir un équivalent féminin à Superman il demande à Binder de créer une Supergirl[1]qui apparaît dans Action Comics 252 daté de [2].
Weisinger améliore l'histoire de Superman. Il est l'éditeur en chef de DC Comics, mais il fut critiqué pour sa gestion autoritaire, allant jusqu'à dicter des histoires aux scénaristes.
Abbie Hoffman le mettra dans son livre who's who intitulé "Steal This Book" en 1971.