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Mohamud Muse Hersi était militaire pendant le gouvernement de Siad Barre, renversé en 1991. Il est attaché militaire en Chine du milieu des années 1970 au début des années 1980. Il devient gouverneur de l'État de Somalie du Nord avant que la Somalie ne sombre dans la guerre civile.
Hersi prend sa retraite au Canada jusqu'à son élection à la présidence du Pount en 2004, mandat qu'il conserve jusqu'en 2009.