Martin Prat, originaire d'Anglet commence le rugby à XV à l'âge de 14 ans avec l'Aviron bayonnais. En 2008[2], déménageant à Pau pour ses études, il rejoint ensuite à l'âge de 19 ans la Section paloise en catégorie Reichel[3],[4]. Un an plus tard, il intègre le centre de formation, au poste d'arrière et en tant que buteur[3],[5]. Malgré son statut d'espoir, il totalise entre autres 18 apparitions en Pro D2 durant la saison 2011-2012 ; alors que le club comptabilise plusieurs blessés, il officie plusieurs fois au poste d'ailier[5],[6].
Il participe en avec deux autres joueurs du club béarnais à un tournoi amical de rugby à sept organisé à Londres, avec l'une des sélections du club Pyrénées rugby sevens[7],[8].
Alors qu'il signe son premier contrat professionnel avec le club palois[3], Prat est prêté pour la saison 2013-2014 au FC Auch[9], durant laquelle il compte 27 titularisations[10]. Au terme de cette année, il retourne à la Section paloise alors qu'il lui reste un an de contrat[11],[12]. Le club béarnais et Martin Prat décrochent au terme de la saison 2014-2015 le titre de champion de France de Pro D2[13].
Bloqué par la concurrence à son poste d'arrière et non conservé par le club[14], Prat signe à l'intersaison 2015 un nouveau contrat avec l'US Dax[15]. Il prolonge de deux saisons supplémentaires en 2017[16]. Malgré la relégation en Fédérale 1, il continue l'aventure avec le club rouge et blanc pour la saison 2018-2019[17].
Opéré du sésamoïde du gros orteil gauche l'été précédent, il choisit de ne pas prolonger officiellement à l'intersaison 2019, donnant la priorité à sa période de convalescence[18]. Un accord tacite conclu avec le président lui permet néanmoins de reprendre la compétition avec le groupe dacquois à la fin du mois de [19]. Alors que l'US Dax s'apprête à disputer l'édition inaugurale de la nouvelle division Nationale, Prat prolonge son contrat pour cette saison 2020-2021[20],[21] ; il est par ailleurs nommé capitaine à l'ouverture de la compétition[22]. Il est éloigné des terrains pendant une partie de la saison en raison d'une rupture de ligament croisé postérieur au genou gauche[23]. Il signe un nouveau contrat d'une année à l'intersaison[24], avant de mettre un terme à sa carrière à l'issue de cette saison 2021-2022[25].