Cet article présente une liste non exhaustive de musées à Malte par collection.

• Musée national d’archéologie de La Valette
• Musée d'archéologie de Gozo à Victoria
• Musée de Ħaġar Qim à Qrendi
• Musée de Għar Dalam à Birżebbuġa
• Domus Romana à Mdina

• Palais de l'Inquisiteur à Vittoriosa
• Armurerie du Palais (en) à La Valette
• Ancienne Prison (en) à Victoria

• Musée national de la guerre à La Valette
• Musée de Malte dans la guerre (en) à Vittoriosa
• Musée de l'aviation de Malte (en) à Ta' Qali

• Musée national des sciences naturelles à Mdina
• Musée de la Nature (anciennement Musée des Sciences Naturelles) à Victoria
• Centre d'interprétation des falaises à Dingli

• Musée maritime de Malte à Vittoriosa
• Musée de voitures d’époque à St Paul's Bay

• Musée du folklore (en) à Victoria
• Musée du folklore à Għarb
• Moulin de Ta’ Kola (en) à Xagħra
• Ir-Razzett tal-Markiz à Mosta
• Musée des jouets à Xagħra
• Musée Tunnara (en) à Mellieħa

• MUŻA, le musée national des Beaux-Arts à La Valette
• Saint James Cavalier à La Valette
• Musée d'art moderne Tempra à Mġarr (Malte)

• Musée du théâtre Manoel à La Valette

• Musée de la Cathédrale Saint-Jean à La Valette
• Musée de la Cathédrale Saint-Pierre et Saint-Paul à Mdina
• Musée de la Cathédrale Notre-Dame-de-l'Assomption à Victoria
• Musée de la Basilique Saint-Georges de Rabat (Gozo)

• Appartement d’État du palais des grands maîtres à La Valette
• Palazzo Parisio (en) à Naxxar
• Palais Falson à Mdina
• Casa Bernard à Rabat (Gozo)
• Casa Rocca Piccola (en) à La Valette
• Musée Wignacourt (en) à Rabat (Malte)

• Centre d’interprétation des fortifications (en) à La Valette
• Tour Wignacourt (en) à St Paul's Bay

• Culture de Malte
• Liste des musées par pays

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