L'activité volcanique a créé le lac il y a quelque 6 000 ans, quand un barrage s'est formé. Le lac avait une transparence de 8 à 9 mètres dans les années 1930, mais la pollution due aux stations thermales locales a réduit cette transparence à 3 ou 4 mètres[3].
Flore et faune
Marimos au fond du lac Akan.
Le lac est connu pour le marimo (Aegagropila linnaei), algues qui s'agrègent en formes sphériques de 2 à 15 cm de diamètre. La flore suivante est aussi présente dans le lac[3].
