Tout a commencé lorsque Jean-François Laguionie, réalisateur de courts-métrages d'animation, dont La Traversée de l'Atlantique à la rame, a trouvé, en se promenant le long d'un cours d'eau, un ancien atelier de bobinage de fil de soie. Il s'y installa pour commencer, avec quelques amis, la réalisation du long-métrage : Gwen, le livre de sable. Existant dans les Cévennes depuis 1979, La Fabrique devient une fondation en 1984. Puis en 1987 elle devient une société de production. Un deuxième long métrage, Le Château des singes, sort en 1995.
Le , la société La Fabrique (340506906) a été mise en liquidation judiciaire[1]. Ses actifs ont été cédés à la société La Fabrique Productions (510945488), mise en liquidation judiciaire à son tour le [2].