Kim Chi-gon connaît sa première sélection avec l’équipe première de Corée du Sud le au cours d’un match amical contre la Turquie.
Toujours en 2004, Kim Chi-gon fait également partie de l’aventure des Jeux olympiques à Athènes avec la sélection olympique sud-coréenne. Il dispute ainsi la première rencontre de la Corée du Sud dans le groupe A face à la Grèce et reçoit un carton rouge juste avant la fin de la première mi-temps alors que son équipe menait 1 à 0.
Poursuivant sa carrière au FC Seoul, Kim Chi-gon est devenu un élément clé de la défense de son club et profite de la confiance que lui ont accordée ses entraîneurs Lee jang-soo, puis Şenol Güneş.
Il a notamment inscrit le deuxième but de sa carrière au cours d’une rencontre de Hauzen Cup contre le Gwangju Sangmu Phoenix en mars 2007.
Fin juin 2007, Kim Chi-gon est sélectionné par Pim Verbeek pour participer à la Coupe d’Asie en Indonésie. Il s’agit du premier grand rendez-vous international avec l’équipe A pour le jeune défenseur. Kim Chi-Gon ne joue toutefois qu'un seul match sur toute la compétition, en entrant en jeu en deuxième mi-temps au cours de la petite finale contre le Japon.
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