Josef Kirchhoff entre le dans l'ordre des frères mineurs et prend le nom de Kilian en l'honneur de saint Kilian, apôtre de la Franconie. Il est ordonné prêtre le , en même temps que Lorenz Jaeger futur archevêque, en la cathédrale Saint-Liboire-et-Saint-Kilian de Paderborn. Il se fait un nom en tant que traducteur des hymnes des Églises orientales du grec en allemand. Le titre et l'inspiration de son œuvre en quatre volumes, Die Ostkirche betet (L'Église d'Orient prie), provient d'un ami moine russe du Mont Athos, Vassili Krivoschein (Kriwoszein). Son confrère Elpidius Markötter, futur martyr, a également collaboré aux traductions pour cet ouvrage.
