Jean-Baptiste Hus passe les deux saisons suivantes à Lyon où il suit de peu le départ de Noverre pour Stuttgart. Appelé à Bruxelles par le directeur du Théâtre de la MonnaieGourville, Hus y arrive au début de la saison 1762-1763. Il partage la charge de maître de ballet avec Felicini et La Rivière. Le , Jean-Baptiste Hus remonte à Bruxelles La Mort d'Orphée, dont la Gazette des Pays-Bas rend longuement compte. Le suivant, il donne Mars et Vénus surpris par Vulcain, ballet qu'il avait créé à Lyon en .
Une danseuse qu'il avait connue à Paris, Élisabeth Bayard, dite Mlle Bibi, lui donne plusieurs enfants nés à Bruxelles et à Lyon. Le couple se marie le 20 septembre 1775, dans la paroisse de Feillens (actuel département de l'Ain)[3]. Lors de cet acte, Jean Baptiste Hus se fait appeler Hus Malo. Le couple reconnaît à cette occasion quatre enfants. L'aîné, Pierre Louis, est déclaré avoir été baptisé à Bruxelles sous le nom de Stapleton, "nom emprunté pour conserver leur réputation et pour n'être pas connu sous leurs véritables noms dans les pays étrangers". Pierre-Louis Stapleton, devenu Pierre Louis Hus Malo par cette déclaration, sera connu plus tard sous le nom d'Eugène Hus. Trois autres enfants sont reconnus par le couple : Jean Pierre, Magdelaine et Pierre François, tous trois nés à Lyon, paroisse Saints Pierre et Saturnin[4].
Le couple retourne ensuite à Lyon et y séjourne vraisemblablement jusqu'en 1779, année où Hus entre au Théâtre-Italien de Paris comme maître de ballet. Peu avant la fermeture du théâtre et la suppression du genre italien en 1780, Hus regagne Lyon et acquiert la direction du théâtre, qu'il partage avec Félix Gaillard, puis ils dirigent le nouveau Théâtre de Bordeaux et reviennent à Lyon de 1784 à 1786.
Après un court séjour à Londres en compagnie de son fils, Hus prend la direction des théâtres de Bretagne jusqu'en 1791, avant de reprendre celle de Bordeaux. Il cesse probablement toute activité peu de temps après et meurt à Metz en 1812.