1 Compétitions officielles nationales et internationales senior, incluant le parcours amateur et en équipe réserve. 2 Matchs officiels. Dernière mise à jour : 2 avril 2021
Une grave blessure mit fin à sa carrière de joueur en 1971 alors que Clemente n'est âgé que de 21 ans. Avant cela, il avait remporté la Coupe d'Espagne en 1969 avec l'Athletic Bilbao.
Comme entraîneur, il remporta deux fois le championnat d'Espagne avec l'Athletic Bilbao en 1983 et 1984. Il demeure l'entraîneur le plus jeune à avoir gagné la Liga. En 1988, il mène l'Espanyol en finale de la Coupe UEFA.
Javier Clemente a été sélectionneur de l'équipe d'Espagne entre 1992 et 1998, puis de la Serbie entre 2006 et 2007. Lors de la saison 2000-2001, il a entraîné l'Olympique de Marseille. Il a remporté à trois reprises le Prix Don Balón de meilleur entraîneur de la Liga.
En février 2012, il prend les rênes du Sporting de Gijón en remplacement de Manuel Preciado. Le , Clemente fête son 500e match comme entraîneur en première division du football espagnol[1].
En , il conclut un « accord de principe » avec le président de la Fédération libyenne de football (FLF) Anouar al-Tachani, pour entraîner l'équipe nationale pendant deux ans à partir d'[2]. Il est limogé le à la suite d'une défaite 4 à 0 face au Congo.
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