Janina Baechle poursuit des études de musicologie et d’histoire à l’université de Hambourg et de chant auprès de Gisela Litz. Elle travaille régulièrement avec Brigitte Fassbaender. Elle devient membre du théâtre de Brunswick (Basse-Saxe) en 1998, où elle se produit jusqu’en 2001 dans les rôles de Auntie (Peter Grimes), Frau Reich (Les Joyeuses Commères de Windsor), Erda et Fricka (L’Or du Rhin), le prince Orlofsky et Leokadja Begbick (Aufstieg und Fall der Stadt Mahagonny). Elle est invitée à Francfort, Baden-Baden, Dresde, Wurtzbourg, Mannheim, Sarrebruck, Kiel, Bâle et Barcelone.
De 2001 à 2004, elle est membre de l’Opéra de Hanovre où elle interprète Amneris (Aïda), la Comtesse Geschwitz (Lulu), Fenena (Nabucco), Cornelia (Giulio Cesare) et Octavian (Le Chevalier à la rose). Elle chante dans Al gran sole carico d'amore (Luigi Nono) au Festival d’Edimbourg en 2004. Elle est invitée par Brigitte Fassbaender pour se produire dans les rôles de Czipra (Der Zigeunerbaron), Azucena (Le Trouvère) et la Nourrice (La Femme sans ombre) à Innsbruck.
Elle se produit également en concert : Deuxième symphonie de Mahler avec Ozawa et le Philharmonique de Vienne ainsi qu'avec Gilbert Kaplan et le New York Philharmonic, Miroir de Jésus de Caplet au Capitole, Elias de Mendelssohn au Festival du Schleswig-Holstein... Elle donne des récitals de Lieder à Vienne, Graz, Brême, etc.
Elle a fait paraître en CD un premier récital Chansons grises (Marsyas) avec des mélodies et des Lieder de Reynaldo Hahn, Lili Boulanger, Alexander Zemlinsky, Alma Mahler...