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Horloge biologique peut faire référence à :

• aux horloges circadiennes, qui contrôlent différents rythmes biologiques, ou directement à une petite partie de l'hypothalamus, appelée noyau suprachiasmatique, qui constitue le siège de l'horloge circadienne centrale chez les mammifères.
• à l'horloge moléculaire, hypothèse en génétique selon laquelle les mutations génétiques s'accumulent dans un génome à une vitesse constante.
• à la chronobiologie, une discipline scientifique étudiant l'organisation temporelle des êtres vivants.
• aux travaux de recherche sur le contrôle des rythmes circadiens, par Jeffrey C. Hall, Michael Rosbash et Michael W. Young, lauréats du Prix Nobel de physiologie ou médecine 2017.

• à Horloge biologique (2005), un film québécois (canadien) de Ricardo Trogi.

• horloge (homonymie)