Guerrilla Games prend son origine dans la volonté de la firme multimédia hollandaise Lost Boys de se lancer dans l'industrie vidéoludique. Celle-ci rachète trois petits studios de développement, « Orangegames », fondé par Arjan Brussee, « Digital Infinity », fondé par Arnout van der Kamp, et « Formula Game Development » afin de créer « Lost Boys Games » au début de l'année 2000[1]. Durant les deux années suivantes, Lost Boys Games développe quatre jeux sur les portablesGame Boy[1].
En 2003, la maison mère décide de se séparer de sa division « jeu vidéo ». Le fondateur de Lost Boys, Michiel Mol, intègre alors l'entité à une autre société multimédia, « Media Republic », qui se voit renommé Guerrilla Games en juillet2003. Désormais indépendant, Guerrilla retient l'attention de grands éditeurs et notamment de Sony Computer Entertainment Europe qui décide de produire Killzone. Le jeu devient un titre phare de l'année 2004 sur PlayStation 2. Leur production suivante, Shellshock: Nam '67, est éditée la même année chez Eidos.
En 2013, Guerrilla se prépare pour la nouvelle console de Sony, la Playstation 4 et sort Killzone: Shadow Fall. Mais en 2016, le studio abandonne sa série de FPS fétiche, et annonce lors de l'E3 la création d'un action-RPG ambitieux dont le développement a débuté depuis plusieurs années : Horizon Zero Dawn. Sorti en , le jeu est très bien accueilli par la critique et les joueurs et un DLC intitulé The Frozen Wilds sort en .
Le 9 mai 2023, le studio fête son 20e anniversaire et, à cette occasion, partage une rétrospective de ses activités. Il livre aussi d'autres informations, comme le fait que les jeux de la franchise Horizon se sont écoulés à 32,7 millions d'unités, dont 8,4 millions pour Forbidden West[2],[3].