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Giovanni Battista Trotti s'est formé à Crémone auprès de Bernardino Campi dont il a épousé la nièce et a hérité de son atelier. Il a décoré le Palazzo del Giardino à Parme. À partir de 1587, il a participé à la décoration de San Pietro al Po à Crémone ensuite il a été employé à la décoration du tribunal de Parme avec Agostino Carracci qui le trouva désagréable, ce qui lui valut le surnom de II Malosso (mauvais os).
Pour faire face aux énormes commandes, beaucoup de ses dessins ont été exécutés par ses élèves, mais il a signé les peintures.
Au début du XVIIe siècle il a été employé en tant que peintre, architecte et architecte d'intérieur par les membres de la Maison Farnèse à Parme, (décoration du Palazzo del Giardino (Palazzo Ducale), et pour cela a été récompensé par le titre de Cavaliere.
Malgré tout, il retourna souvent à Crémone afin de superviser son atelier à la décoration de l'oratoire du Christ ressuscité (San Luca, Crémone), pour travailler à l'autel de la cathédrale du Saint-Sacrement et à la conception des décorations en l'honneur de Philippe III d'Espagne et de Marguerite d'Autriche.
Nativité (1584), église des saints Ambrogio et Simpliciano, Carate Brianza.
Déposition, huile sur toile, Pinacothèque, Crémone.
Aux U.S.A. et en France
Dieu le Père entouré par des anges et des saints, plume et encre brune, lavis gris-bleu de 41 cm × 41 cm, Pandora Old Masters, New York.
Saint Pierre et saint Paul adorant la Vierge à l'Enfant, plume et encre brune, lavis brun, mis au carreau à la pierre noire de 36,1 cm × 26,8 cm, Musée des Beaux-Arts, Marseille
(en) Dottore Pasquale Coddè, Segretario dell Belle Arti in Mantova et Aumentate e scritte Dottore Fisico, Luigi Coddè (éditeur), Memorie Biografiche, poste in forma di Dizionario die Pittori, Scultori, Architetti, ed Incisori Mantovani, Fratelli Negretti, Mantue, numérisé par Googlebooks d'Oxford University le 16 octobre 2006, (lire en ligne), p. 120-123