La gare de Boissise-le-Roi n'existait pas lors de la création de la ligne de Corbeil à Melun et à Montereau en 1897. Elle a été mise en service le 28 mai 1955.
Jusqu'à la mise en service de la partie sud de la ligne D du RER en 1995, les trains desservant la gare de Boissise-le-Roi effectuaient des trajets réguliers entre Paris-Gare-de-Lyon et la gare de Melun tous les jours de la semaine, en soirée et jusqu'après minuit. Ce n'est qu'à partir de 1999 que Paris n'a plus été desservie aux heures de pointe en semaine et qu'un système de navettes entre Melun et la gare de Juvisy a été mis en place. Puis, en 2005, les trains de soirée et de nuit ont été remplacés par des cars du réseau Noctilien[1],[2].
Depuis 2005, la gare n'est plus desservie par les trains au départ de Corbeil-Essonnes et de Melun en soirée et la nuit. La ligne 500 du réseau de bus Évry Centre Essonne assure à la place la desserte des gares entre Corbeil-Essonnes et Melun[3].
En 2011, les navettes entre Juvisy et Melun sont principalement assurées par des rames Z 5300, alors qu'aux heures creuses et le weekend, les trains en direction de Paris, et au-delà, sont assurés par des rames Z 20500.
En 2014, selon les estimations de la SNCF, la fréquentation annuelle de la gare est de 113 400 voyageurs[4].
À partir du mois de , lors de la mise en place du service annuel 2019, la desserte de la gare est modifiée : il n'y a plus d'accès direct vers Paris ; aux heures de pointe, des navettes assurent des liaisons Melun - Corbeil-Essonnes et, aux heures creuses, des navettes assurent des liaisons Melun - Juvisy via Ris-Orangis. Par ailleurs, toutes les rames Z 5300, qui assuraient les navettes Juvisy – Melun ont été retirées de la ligne.
Au début du mois de , les premières rames Z 57000 sont mises en service sur la liaison Melun - Corbeil-Essonnes - Juvisy (via Ris-Orangis).
Service des voyageurs
Accueil
La gare de Boissise-le-Roi ne dispose pas de bâtiment voyageurs. Aucune présence commerciale n'est assurée dans la gare. Seul un automate permet la délivrance de titres de transport[5].
Chaque quai de la gare est équipé d'un abri voyageurs semi-fermé.
Les accès aux quais se font uniquement depuis la voirie. Il n'existe pas de passage souterrain ni de passerelle ; le passage d'un quai à l'autre se fait obligatoirement par le passage à niveau situé immédiatement à l'extrémité est de la gare. Cette situation est problématique lorsque les barrières du passage à niveau sont abaissées puisque les voyageurs ne peuvent plus accéder au quai opposé.
Desserte
La gare est desservie par les trains du RER D. Aux heures de pointe, seules des navettes Juvisy - Corbeil - Melun circulent. Aux heures creuses et le weekend, tous les trains desservent Paris-Gare-de-Lyon et au-delà vers le nord, selon les missions.
René-Charles Plancke, Histoire du Chemin de Fer de Seine-et-Marne. Tome I, De la vapeur au TGV, Le Mée-sur-Seine, Lys Éditions Presse - Éditions Amattéis, , 511 p. (ISBN2-86849-105-7)