La flore des Pyrénées-Orientales est l'ensemble des espèces de plantes présentes dans le département des Pyrénées-Orientales, dans la région Occitanie, dans le sud de la France. Elle comprend plus de 2 700 espèces, réparties depuis le littoral méditerranéen jusqu'au relief des Pyrénées à presque 3 000 m d'altitude^[1].

Le département des Pyrénées-Orientales comprend six écosystèmes différents^[1] :

• Le littoral méditerranéen ;
• Les plaines et basses collines, avec notamment du chêne vert et parfois du chêne-liège ;
• L'étage collinéen, avec du chêne rouvre et du chataignier ;
• L'étage montagnard, avec du hêtre et du sapin ;
• L'étage subalpin, avec du pin à crochets ;
• L'étage alpin, où les arbres disparaissent, laissant la place au rhododendron et au genévrier nain.

Certaines espèces ne sont présentes que dans le département des Pyrénées-Orientales.

La Dauphinelle des montagnes n'existe que dans la vallée d'Eyne.

Une espèce de Myosotis, le Myosotis ruscinonensis (ou Myosotis du Roussillon) était endémique des sables herbeux sur le littoral entre Argelès-sur-Mer et Collioure^[1]. Elle disparait à l'état naturel au cours du XX^e siècle^[2].

• Oriol de Bolòs y Josep Vigo, Flora dels Països Catalans ed. Barcino 4 tomes (en catalan) couvre aussi les PO.

• Gaston Gautier, Catalogue raisonné de la flore des Pyrénées-Orientales, Perpignan, Société agricole, scientifique et littéraire des Pyrénées-Orientales, 1897, 551 p. (BNF 30489747)
• (fr + ca) Jean Bouchard, Flora catalana, vol. I : Capcir, Cerdanya, Conflent, Rosselló, Vallespir, Salanca, La Costa, Els Aspres, Les Alberes, Prades, Terra Nostra, 1971
• (fr + ca) Jean Bouchard, Flora catalana, vol. II : Capcir, Cerdanya, Conflent, Rosselló, Vallespir, Salanca, La Costa, Els Aspres, Les Alberes, Prades, Terra Nostra, 1975
• Alain Pottier (dir.) (ill. Paul Schramm, photogr. Michel Castillo), À la conquête des plantes à parfum, aromatiques et médicinales du Roussillon, Canet-en-Roussillon, Éditions Trabucaire, 2017, 189 p. (BNF 45410783)
• Joan Tocabens, Herbes magiques et petites formules : Sorcellerie en Roussillon et autres Pays Catalans, Perpignan, Ultima Necat, 2012, 141 p. (ISBN 978-2-36771-002-0)
• Ministère de l'agriculture et de la pêche, Résultats du troisième inventaire forestier : Pyrénées-Orientales, 1994 (lire en ligne)
• L. Conill, « Les richesses végétales des Pyrénées-Orientales », Bulletin de la Société agricole, scientifique et littéraire des Pyrénées-Orientales, Perpignan, n^o 56,‎ 1915-1923

• Le catalogue raisonné de Gaston Gautier au format html

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