Aux Jeux olympiques de Rio de Janeiro, elle se qualifie pour la finale du 3000m steeple en battant son record national en 9 min 30 s 54 puis termine 18e de la finale[1].
Parallèlement à sa carrière sportive, Fabienne Schlumpf travail à temps partiel comme employée de commerce à l'administration municipale de Wetzikon.
En 2017, lors des 10km de Payerne, elle bat le record national féminin de 10km sur route vieux de 15 ans[2]. Le 15 juin, elle bat lors des Bislett Games d'Oslo son propre record de Suisse du 3 000 m steeple en 9 min 21 s 65.
Le 12 août 2018, lors des championnats d'Europe de Berlin, Fabienne Schlumpf décroche sa première médaille internationale à l'occasion de la finale du 3 000 m steeple. Menant de bout en bout la course, elle n'est devancée que dans la dernière ligne droite par la tenante du titre allemande Gesa Felicitas Krause. En 9 min 22 s 29, son meilleur temps de la saison, elle remporte donc la médaille d'argent derrière l'Allemande (9 min 19 s 80) et devant la Norvégienne Karoline Bjerkeli Grøvdal (9 min 22 s 46)[3]. Le 14 octobre, lors des 10 kilomètres de Berlin elle abaisse son propre record de 2017 à 32 min 1 s et termine troisième de cette course[4].Le 17 novembre, elle remporte la Corrida bulloise, une course populaire dans les rues de Bulle en 19 min 41 s[5]. Le 9 décembre, Schlumpf termine deuxième en 26 min 6 s de la course sénior des Championnats d'Europe de cross-country à Tilbourg, aux Pays-Bas, se classant juste derrière la Turque Yasemin Can[6].
Le , elle se classe treizième des championnats du monde de semi-marathon à Gdynia en 1 h 8 min 38 s, améliorant son propre record de plus d'une minute trente et établissant un nouveau record de Suisse[7].
Elle court son premier marathon le lors de l'épreuve de qualification des Jeux olympiques d'été de 2021 organisée par Swiss Athletics à Belp. Elle décroche son ticket haut la main en signant un nouveau record national en 2 h 26 min 14 s[8].
En janvier 2022, Fabienne Schlumpf met sa carrière sportive entre parenthèse à la suite d'une inflammation du muscle cardiaque[9]. Elle effectue son retour à la compétition en juin 2022 lors de la course féminine suisse qu'elle remporte pour la troisième fois[10].
Le , elle réalise une solide course lors du marathon de Berlin. Elle se classe quinzième en 2 h 25 min 27 s et améliore son propre record de Suisse de la distance[11].