Thys van den Audenaerde est ingénieur agronome diplômé de l'Université de Gand en 1956 avec une thèse intitulée "Bijdrage tot de systematiek en tot de kennis van het voedingsregime der Tilapia-soorten van Belgisch Kongo"[1]. Il a ensuite obtenu un diplôme en sciences animales à l'ULB en 1959. En 1970, il fait un doctorat à Gand sur la thèse « Contribution à une monographie systématique et bibliographique du genre Tilapia (Poissons, Cichlidae) »[2]. Entre-temps, il était devenu assistant de recherche au Musée royal de l'Afrique centrale où il est devenu directeur par intérim en 1980 et directeur en 1985, jusqu'à sa retraite en 1999. De 1975 à 1999, il a également été professeur extraordinaire à la KU Leuven.
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