Christian Frémont est fils d'agriculteurs. Il suit des études de lettres à la faculté de lettres de l'université de Bordeaux. Il est ensuite admis à Sciences Po Bordeaux.
Il est directeur adjoint entre 1977 et 1980, directeur des stages de l'ENA entre 1980 et 1990, avant d'occuper successivement les fonctions de préfet de l'Ariège en 1991 et 1992, puis du Finistère de 1992 à 1996, enfin du Pas-de-Calais jusqu'en 1997, date à laquelle il devient directeur général de l'administration au ministère de l'Intérieur.
Lors du Conseil des ministres du , sur proposition du ministre de l’Intérieur, de l’Outre-mer et des Collectivités territoriales, « il est mis fin aux fonctions de préfet de M. Christian Frémont, préfet de la région Provence-Alpes-Côte d’Azur, préfet de la zone de défense sud, préfet des Bouches-du-Rhône (hors classe) »[4].
Il est alors pressenti officieusement pour devenir directeur de cabinet d'Alain Juppé, ministre d'État, ministre de l'Écologie, du Développement et de l'Aménagement durables, au lendemain de la constitution du gouvernement Fillon I. Cependant, la défaite du ministre aux élections législatives et la démission de ce dernier annulent l'arrêté de nomination qui devait être publié après les élections. Christian Frémont est donc nommé au poste de directeur de cabinet de Jean-Louis Borloo, successeur d'Alain Juppé.
Après la défaite de l'ancien président en 2012, il continue à travailler pour lui lorsqu'il installe ses bureaux rue de Miromesnil, avant d'être remplacé par Michel Gaudin[3].
Christian Frémont meurt d'un cancer en 2014 ; il est inhumé dans son village natal[3].