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En dépit de sa conception morale religieuse, il fait preuve d'ouverture d'esprit en acceptant la thèse de l'évolution développée par Charles Darwin dans L'Origine des espèces (On the Origin of Species), publié en 1859.
Farouche opposant à l'Église catholique il fut virulent dans sa critique de John Henry Newman lorsque celui-ci demanda son admission dans l'Église catholique (1845), l’accusant par écrit de mensonge et de tromperie. Ce qui incita ce dernier à écrire son Apologia Pro Vita Sua. Kingsley fait également preuve de racisme dans une lettre envoyée à sa femme depuis l'Irlande, où il compare les catholiques irlandais à des chimpanzés blancs.
Publié en français sous le titre Hypathia, ou le Triomphe de la foi, Paris, A. Le Clère, 1857 (BNF30681939)
Westward Ho!, roman (1855)
Publié en français sous le titre Cap à l'ouest ! Les héros de la mer au temps de l'Invincible Armada, Paris, Casterman, coll. « Le Rameau vert », 1954 (BNF32308777) ; réédition, Monein, éditions PyréMonde, coll. « Au viu leupard », 2007 (ISBN978-2-84618-480-9)
Two Years Ago, roman (1857)
Publié en français sous le titre Il y a deux ans, 1854-1856, Paris, Hachette, 1860 (BNF39321371)
Publié en français sous le titre Les Bébés d'eau : conte symbolique, Paris, Dorbon aîné, 1914 (BNF36059949)
Publié en français sous le titre Tom au Pays des ondines : conte de fées, Paris, Gautier-Languereau, coll. « Bibliothèque de Suzette », 1951 (BNF32308768)