Disputé sous une pluie battante, le championnat de Zurich a vu la victoire de l'Espagnol Samuel Sánchez (Euskaltel-Euskadi). Celui-ci a fini en solitaire après avoir distancé ses ex-compagnons d'échappée à moins de quinze kilomètres de l'arrivée. La seconde place revient à l'Australien O'Grady (Team CSC) devant Rebellin (Gerolsteiner).
L'Espagnol Alejandro Valverde, absent de cette épreuve conserve toutefois sa première place du ProTour avant les deux grands derniers rendez-vous de la saison que sont Paris-Tours 2006 (dimanche 8 octobre) et le Tour de Lombardie (samedi 14 octobre).
Après cette épreuve, il est mathématiquement assuré de remporter le classement de l'UCI ProTour 2006.