En pathologie végétale, on appelle « carie » diverses maladies fongiques (causées par des champignons). C'est un symptôme qui est dû à des attaques d'espèces pouvant appartenir à des groupes très différents. L'intérieur de l'organe attaqué est gâté et transformé en une masse pulvérulente, d'où l'analogie avec une carie dentaire. Les symptômes où l'organe attaqué est complètement remplacé par une masse pulvérulente sont regroupés sous le terme de charbon.
Parmi les caries on trouve notamment :
les caries du tronc des arbres, dues le plus souvent à diverses espèces de Polyporales :