Antoine Faivre a publié de nombreux livres depuis 1962 sur l'ésotérisme et la philosophie naturelle. Il passe pour être le chercheur de la fin du XXe siècle qui a contribué de façon décisive à l'établissement de cette branche de recherche[4]. Il a dirigé plusieurs revues telles Les Cahiers de Saint-Martin, les Cahiers de l'Hermétisme, Aries. Association pour la Recherche et l’Information sur l’Ésotérisme et une nouvelle série en anglais Aries. Journal for the Study of Western Esotericism. Il est membre du comité scientifique de Politica Hermetica, et membre du conseil consultatif scientifique de la revue Suevica.
Manuela Maddamma, qui a étudié à Paris l'histoire de l'ésotérisme, s'est inspirée de lui pour le personnage du professeur Faiville dans le roman noir historico-ésotérique Lascia che guardi[7].
Publications
Les vampires. Essai historique, critique et littéraire, Paris, Le Terrain vague, 1962
Kirchberger et l’Illuminisme du XVIIIe siècle, collection « Archives Internationales d’Histoire des Idées », La Haye, Nijhoff, 1966
Eckartshausen et la théosophie chrétienne, Paris, Klincksieck, 1969 (réédition avec une préface de Jean-Marc Vivenza, Hyères, La Pierre Philosophale, 2016)
L’ésotérisme au XVIIIe siècle en France et en Allemagne, La Table d’Émeraude, Seghers, 1973
Mystiques, théosophes et illuminés au siècle des lumières, Hildesheim, Olms, 1976
Toison d'or et alchimie, Milan, Archè, 1990. Traduction anglaise (texte très augmenté) : Golden Fleece and Alchemy, Albany, State University of New York Press, 1993, reprint 1995.
Philosophie de la nature (physique sacrée et théosophie, XVIIIe – XIXe siècles), Paris, Albin Michel, 1996 (Prix de philosophie Louis Liard, de l'Académie des Sciences morales et politiques). Édition italienne en cours.
(en-US) The Eternal Hermes. From Greek God to Alchemical Magus, Grand Rapids, Phanes Press, 1996. Édition italienne : I volti di Ermete, Rome, Atanor, 2001.
Accès de l'ésotérisme occidental, Paris, Gallimard (« Bibliothèque des sciences humaines »), vol. I, 1986, 2e éd., 1996, et vol. II, 1996. Traduction anglaise du vol. I : Access to Western Esotericism, Albany, State University of New York Press, 1994, et du vol. II : Theosophy, Imagination, Tradition. Studies in Western Esotericism, Albany, State University of New York Press, 2000.
L'ésotérisme, Paris, PUF, coll. « Que sais-je ? », 2007, 4e édition, revue et corrigée, 2003. Traduit en sept langues[8].
De Londres à Saint-Pétersbourg. Carl Friedrich Tieman (1743-1802) aux carrefours des courants illuministes et maçonniques, Milan, Archè, 2018
