Anne Jagellon naît le à Buda, de Vladislas IV, roi de Hongrie et de Bohême, et d’Anne de Foix, troisième épouse du souverain, celui-ci ayant répudié ses deux précédentes femmes, Barbara de Brandebourg et Béatrice de Naples, qui n'étaient pas parvenues à lui donner une descendance. Vladislas, âgé de 47 ans, est désespéré alors d'avoir jamais un fils pour lui succéder. La jeune Anne de Foix réussit à combler les attentes de son époux, en lui donnant, moins de dix mois après leur mariage, un enfant. Bien qu'Anne ne fût pas un garçon, sa naissance est accueillie avec beaucoup de joie. Héritière présomptive du trône de son père durant les trois premières années de sa vie, elle a un petit frère en 1506, prénommé Louis. Hélas, la reine se remet mal de l'accouchement et décède quelques semaines plus tard.
Mariage
Vladislas IV, monarque consciencieux, tient à préserver au maximum la paix et l'harmonie au sein de son royaume, quitte à prendre de sévères mesures contre les rebelles, comme le prouve l'exécution de György Dózsa. Si son règne est considéré comme stable, les frontières de ses possessions souffrent de l’avidité des voisins, les Ottomans et les Habsbourg. Afin de freiner la soif d'expansion du Saint-Empire romain germanique, il arrange, à partir de 1515, le mariage de ses enfants à Ferdinand et Marie de Habsbourg, petits-enfants de Maximilien Ier du Saint-Empire.
Bien que le roi meure l'année suivante, le projet n’est pas abandonné et, en 1522, Anne et Louis II Jagellon prennent époux.
Un an auparavant, en 1521, Hans Maler peint le portrait d'Anne Jagellon.
Anne, qui allait avoir 18 ans, devient l'épouse de l'archiduc Ferdinand d'Autriche, gouverneur de Tyrol, ce qui fait d’elle la belle-sœur de l'empereur et roi Charles Quint et des reines de France, du Portugal et de Danemark.
Reine de Hongrie et de Bohême
En 1526, le jeune Louis II de Hongrie tombe à la Bataille de Mohacs. N'ayant pas encore d'enfant de son mariage avec l'archiduchesse-infante Marie, il laisse le trône à sa sœur (qui vient de mettre au monde son premier enfant) et son mari.
La famille des nouveaux monarques ne cesse de s'agrandir. Cette nombreuse progéniture sera destinée à servir la politique matrimoniale des Habsbourg, qui avait toujours constitué pour eux un important atout.
Ferdinand et Anne eurent une descendance nombreuse qu'ils mirent au service de la politique dynastique de leur époque :
Anne Jagellon est, durant toute sa vie, une femme digne et déterminée. Lorsque Zapolski, voïvode de Transylvanie, assiège Vienne, la reine, qui s'y trouve enfermée, montre un grand courage et beaucoup de fermeté. Couronnée reine des Romains en 1533, son mari ayant été reconnu successeur de Charles Quint, elle ne devient cependant jamais impératrice, mourant le , à Prague, à l'âge de quarante-quatre ans, quelques jours après avoir donné naissance à Jeanne, future grande-duchesse de Toscane. Ferdinand ne ceignit la couronne impériale que neuf ans plus tard, en 1556, à la suite de l'abdication de son frère aîné.