Membre du Parti ouvrier unifié polonais (PZPR), il est élu à la Diète en 1989 dans la circonscription de Poznań-Stare Miasto. Il quitte le PZPR l'année suivante pour rejoindre l'Union sociale-démocrate polonaise (PUSD), puis n'est pas réélu député en 1991. En 1992, il décide d'adhérer à l'Union du travail (UP).
Il postule de nouveau à un siège de député au cours des élections législatives du 23 septembre 2001, sous les couleurs de la coalition SLD-UP. Avec 6 424 suffrages de préférence, il réussit à faire son retour à la Diète. Il occupe notamment la présidence de la commission de l'Agriculture et du Développement rural.
Le , Andrzej Aumiller est nommé ministre des Travaux publics dans le gouvernement de coalition du conservateur Jarosław Kaczyński. Il est relevé de ses fonctions après la rupture de la coalition au pouvoir, le . Aux élections législatives anticipées du 21 octobre, il postule dans la circonscription de Konin, mais la SRP n'atteint pas le seuil de représentativité à la Diète.