En 1340, Louis IV le Bavarois réunit la Haute-Bavière et la Basse-Bavière avec pour unique capitale Munich. Mais le duché fut à nouveau scindé neuf ans plus tard : ses cinq fils partagèrent le duché entre Straubing-Hollande, Haute-Bavière et Basse-Bavière-Landshut. Cette dernière région échut à Étienne II, lequel parvint à réunir à son fief celui de Haute-Bavière (1363) après la mort de son frère Louis V étant décédé.
À la mort d'Étienne II, ses trois fils Étienne III, Frédéric et Jean II lui succédèrent, d'abord conjointement, puis ils procédèrent à un nouveau partage du duché (1392) : furent créés les trois duchés de Bavière-Munich (à Jean), Bavière-Ingolstadt (à Étienne) et Bavière-Landshut. Le premier duc de la région la plus riche, celle de Bavière-Landshut, fut Frédéric le Sage, qui régna de 1375 à 1393 et qui inaugura l'ère des riches ducs de Landshut.
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