Mâle syntyi Auvergnen maakunnassa ja oli oppilaana École normale supérieuressa, josta hän valmistui vuonna 1886. Hän opetti ensiksi retoriikkaa Saint-Étiennessa ja sittemmin Toulousen yliopistossa. Hän väitteli tohtoriksi vuonna 1899 kolmiosaisella, mammuttimaisella teoksellaan Art religieux du XIIIe siècle en France. Hän opetti kristillisen taiteen historiaa Sorbonnessa vuodesta 1906 lähtien ja oli saman aiheenoppituolin haltija vuodesta 1912.
Vuosina 1923 ja 1937 hän toimi Roomassa sijaitsevat Ranskan tutkimusinstituutin École française de Rome johtajana, ja tässä tehtävässä hän seurasi akatemian jäsentä Louis Duchesnea.
Kunnianosoitukset
Émile Mâlelle myönnettiin hänen elinaikanaan useita akateemisia ja muita virallisia kunnianosoituksia, joista mainittakoon:
Académie des inscriptions et belles-lettres -jäsenyys (1918)
Académie royale de Belgique -jäsenyys
British Academy -jäsenyys
Ranskan akatemian jäsenyys
Ranskan kunnialegioonan suurupseerin arvo
Teokset
Quomodo Sybillas recentiores artifices representaverint (1899)
L'Art religieux du XIIIe siècle en France (1899) - väitöskirja
L'Art religieux de la fin du Moyen Âge en France (1908)
L'Art allemand et l'art français du Moyen Âge (1917)
L'Art religieux après le Concile de Trente, étude sur l'iconographie de la fin du XVIe, du XVIIe et du XVIIIe siècles en Italie, en France, en Espagne et en Flandre (1932)